土地用途改变
土地用途改变是20世纪70年代以来陆地和淡水生态系统退化的最大直接驱动因素。主要包括开垦、基础设施建设、城市扩张、采矿、道路扩建、水电大坝以及管线建设等。这些活动造成毁林、生境破碎化等，进而导致生物多样性丧失。海洋和沿海土地利用变化包括沿海挤占生境、近海水产养殖、海水养殖、底拖网捕捞、陆上开荒、沿海城市扩张等。
生物资源过度利用
生物资源过度利用是一些物种成为珍稀濒危物种甚至灭绝或资源物种减少的重要原因。其中，盗猎和贸易直接将很多野生动物推向灭绝的边缘。过去50年中，鱼类和海产品过度利用为海洋生物多样性丧失的最大驱动因素。
气候变化
气候变化对物种的分布、物候、种群动态以及物种组合或生态系统结构和功能已经产生了明显影响，而且正在变得越来越严重。47%的受威胁哺乳动物和23%的受威胁鸟类可能已经受到气候变化的影响，许多无法适应快速气候变化的物种，则面临着更大的威胁。因臭氧损耗而增加的紫外线也对农、林、牧、渔相关的生物多样性造成严重的威胁。
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