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而后3-磷酸甘油酸消耗1分子ATP,在甘油酸激酶的作用下形成1,3-二磷酸甘油酸。又消耗1分子NADPH,形成3-磷酸甘油醛。之后在磷酸丙糖酶的作用下,形成3-磷酸丙糖。继续消耗1分子ATP,重新形成RuBP。后来经过一系列复杂的生化反应,一个碳原子将会被用于合成葡萄糖而离开循环。剩下的五个碳原子经一系列变化,最后在生成一个1,5-二磷酸核酮糖,循环重新开始。循环运行六次,生成一分子的葡萄糖。