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一般极性大的样品用反相色谱柱,流动相极性大于固定相极性,样品极性越小,保留时间越长。极性小的样品用正相色谱柱,流动相极性小于固定相极性,样品极性越大,保留时间越长。当然如果有其它保留机理,如氢键等,波流时间会变化。固定相不同保留能力会有不同,如C8的保留能力弱于C18。流动相根据不同的溶解能力、极性等也会影响保留时间,同时溶液pH值会影响样品的状态,也会影响保留时间。