除很年幼的儿童和65岁以上的老年人以外，某些慢性病患者发生肺炎球菌感染和重症肺炎球菌性疾病的危险性也会增加。
慢性心血管病（如充血性心力衰竭和心肌病）患者、慢性肺疾病（如慢性阻塞性肺疾病或肺气肿）患者、慢性肝病（如肝硬化）患者、糖尿病患者、酒精中毒者或哮喘患者（并发慢性支气管炎、肺气肿、或长期使用全身性皮质激素时）发生肺炎球菌疾病的危险性增加。通常此类成年人群的免疫能力正常。
高危患者包括：对多糖抗原的反应性降低者、或由以下原因导致血清抗体浓度加速下降者：免疫抑制状况（先天性免疫缺陷、人类免疫缺陷病毒[HIV]感染、白血病、淋巴瘤、多发性骨髓瘤、何杰金氏病或一般恶性肿瘤）；器官或骨髓移植；使用烷化剂、抗代谢剂、或全身性皮质激素治疗；慢性肾衰或肾病综合症。
功能性或解剖性无脾患者（如镰状细胞病或脾切除）受肺炎球菌感染的危险性最高，这是由于此种状况会导致荚膜细菌从血流中的清除能力降低。患有镰状细胞病或脾切除的儿童发生死亡率极高的爆发性肺炎球菌败血症的危险性增高。
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