类病毒是共价闭合单链环状RNA分子，大小为246-399nt。
拟病毒的粒子中含有两类核酸，一类为线状单链RNA（RNA-1），相对分子质量较大约1.5×10）；另一类是环状单链RNA（RNA-2）。
拟病毒有两种分子结构，一是环状RNA-2，二是线状RNA-3。RNA-2和RNA-3是由同一种 RNA 分子所呈现的两种不同构型，其中RNA-3可能是RNA-2的前体，即RNA-2是通过RNA-3环化而形成。
RNA-2不能单独侵染寄主和复制自身。拟病毒的RNA-1与RNA-2之间存在着互相依赖的关系，两者必须同时存在才能感染寄主、复制核酸和产生新的拟病毒粒子。
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