根含秦艽碱甲即是龙胆碱（gentian－ine），秦艽碱乙即是龙胆次碱（gentianidine），秦艽碱丙（gentianal），龙胆苦甙（gentiopicroside），当药苦甙（swertia－marin）。另有报道，秦艽根主含龙胆苦甙，在提取分离时，龙胆苦甙与氨水作用转化为龙胆碱和秦艽碱丙等生物碱。近有报道，秦艽根含龙胆苦甙，褐煤酸（montanic acid），褐煤酸甲酯（methyl montanate），栎瘿酸（roburic acid），α-香树脂醇（α-amyrin），β-谷甾醇（β-sitosterol），β-谷甾醇-β-D-葡萄糖甙（β-sitos-terol-β-D-glucoside）。
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