最常见的不良反应有：恶心、厌食、体温上升、红斑及瘙痒、头痛、心悸。
下面所列的不良反应较少见，且可能与剂量有关：
血液系统反应：红细胞异常（如：溶血性贫血、巨细胞症），紫绀
胃肠道反应：胃痛及腹痛
中枢神经系统反应：头晕、耳鸣
肾脏反应：蛋白尿、血尿
皮肤反应：皮肤黄染
下列反应可能与剂量无关：
血液系统反应：骨髓抑制如伴有白细胞减少、粒细胞减少、血小板减少
消化系统反应：肝炎、胰腺炎
中枢神经系统反应：周围神经病变、无菌性脑膜炎
皮肤反应：出疹、荨麻疹、多形性红斑/Stevens-Johnson综合征、脱落性皮炎、表皮坏死溶解综合征、光敏感性
肺部反应：肺部并发症（纤维性肺泡炎伴有如：呼吸困难、咳嗽、发热、嗜酸粒细胞增多症）
其他过敏反应：眶周水肿、血清病、LE综合征、肾病综合征
男性生殖功能絮乱：曾报道使用柳氮磺吡啶治疗的男性出现精液缺乏性不育。停止用药可逆转此反应。
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