(1)对于有充血性心力衰竭危险因素的患者，包括缺血性心脏病、瓣膜性心脏病、慢性阻塞性肺疾病、肾功能衰竭和其他水肿性疾病患者，应权衡利弊谨慎使用伊曲康唑，并在使用中严密观察充血性心力衰竭的症状和体征，一旦出现充血性心力衰竭，立即停止本品的治疗。
(2)使用伊曲康唑时偶有患者出现严重的肝毒性，包括肝衰竭和死亡，某些患者治疗前并无肝病史，也无严重原发疾病，因此疗程中应监测肝功能。用药过程中如持续有肝病的症状和体征出现，需立即停药并进行肝功能检查。原有肝酶升高者、活动性肝病者，或接受过其他肝毒性药物者不宜应用本品，除非使用本品后患者的利大于弊。如应用本品，需严密监测肝功能变化，一旦患者出现肝功能不全的症状和体征，应立即停药，并予相应处理。
(3)吡咯类抗真菌药物之间交叉过敏反应尚无资料，但本品用于对其他吡咯类抗真菌药有过敏史者时需谨慎。
(4)如伊曲康唑治疗过程中出现周围神经病变，且与伊曲康唑胶囊有关时，需停药。
(5)有报道在伊曲康唑治疗过程中患者出现一过性或持续性的失聪，尤其是老年患者。一旦出现应停用。
(6)伊曲康唑的胶囊及口服液不可互换使用，因为其吸收程度不同，胶囊的口服吸收较口服水溶液差，仅后者治疗食管念珠菌病有效。
(7)胃酸降低时可影响本品的吸收，因此接受抗酸药者，应在服用本品后至少2小时方可服用抗酸药物。
(8)应用本品胶囊时，宜与食物同服，以增加吸收，但应用本品口服溶液时则宜空腹服用。
(9)本品主要自肝脏代谢，肝硬化患者消除半衰期延长，需调整剂量。
(10)哺乳期妇女应用伊曲康唑时应停止授乳。
(11)不推荐伊曲康唑在儿童患者中应用。
(12)在年龄>65岁患者中应用本品注射剂的临床资料少，因此老年人应慎用本品。
(13)肺囊性纤维化患者如服用本品口服液治疗效果不佳，应改换其他治疗。
(14)伊曲康唑的静脉注射液中含赋形剂羟丙基一B一环糊精，静脉注射后，80％～90％的羟丙基一p环糊精自肾清除。因此肌酐清除率<30mg／min的患者不可使用本品注射液。
(15)妊娠妇女口服和注射给药属美国FDA妊娠风险C级。
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