拍摄完三维立体图像,下一步我们就要查看所得的图像效果,并根据实验的设计进行动画拍摄或三维测量分析。
首先,
左边是参数设定,我们可以把图像背景调成黑色增加对比度,添加边框和标尺。
鼠标左键可以对图像进行任意旋转,鼠标右键可进行图像移动,鼠标滚轮可以对图像进行放大缩小。
上面工具栏也可以对图像进行不同展示,例如红绿双色通道可分开或合并展示。
另外,我们还可以制作动画,勾选movie editor,记录每一个动作,
然后可进行图像旋转,再add一下,再放大,add一下。把每一个动作都添加进去。
然后
完成后,该动画可通过
完成了这些三维可视化的操作,我们就可以
界面分两部分,左边是流程化步骤,右边是画面。
我们以统计蓝色DAPI的细胞数目为例,首先第一步,选择需要分析的文件,下面选择需要分析的蓝色通道channel 1,然后选择分析整个3D图像,无压缩。
第二步是对图像进行滤镜优化,下面有很多不同方法。对于质量较好图像可直接略去,直接进入第三步阈值的设定。可直接拉动两边的slider进行范围框选。
然后第四步和第五步分别是对第三步的数值进行优化。
之后进入第六步,选择分析整张图片。然后
下面就可以看到总共统计的细胞数目6142个,
最后可
这边也可以看到整张图片的汇总信息,如体积、表面积、数目等,并可以右键导出。
THUNDER不仅在组织与活细胞样本上实现快速大面积高清扫描,在多孔板上也可进行高内涵快速成像,并进行无痕拼图。下一期我们以24孔板为例,为您讲述THUNDER的应用。
往期回顾
手把手教你用THUNDER——多通道拍摄篇
手把手教你用THUNDER——时间序列拍摄篇
手把手教你用THUNDER——Z-stack拍摄篇
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