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气冲斗牛,一年51篇CNS!

赛多利斯实验室
2021.1.06

Octet

陈老湿曾经在19年5月写了一篇《三年52篇CNS》的文章,列举了使用或引用基于生物层干涉技术(BLI)的Octet/BLItz互作分析仪数据的CNS(Cell,Nature,Science三家顶尖科学杂志)文章的研究方向分类。而在过去的2020年,仅在一年时间之内,CNS的发表数量就达到了51篇!我们将这些文章进行汇总和分析,看看在特别的2020年里科学家们是怎么玩转BLI技术的。

1

 以研究方法分类

研究分子间的相互作用可揭示各种生命活动最本质的奥秘。其涉及的应用非常广,从病原菌浸染机制、新靶点发现、疾病发生机理等基础医学部分,到植物生理、农业等各个领域,以及小分子药物、抗体药物和疫苗的开发。

由于新冠肺炎突如其来,有多篇围绕新冠中和抗体(含蛋白质药物)的研究相继发表,因此病毒中和抗体研究的数量几乎占据了半壁江山。我们的Octet/BLItz互作分析仪可谓是当之无愧的筛选中和抗体利器。

另外值得注意是有关蛋白质从头设计的文章也达到了4篇,这在以前比较少见。可见这个领域正逐渐由冷转热。

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2

 以目标分子种类分类

图中可见,应用BLI技术分析的目标分子依旧是五花八门,种类繁多。除了以往经典的蛋白-蛋白以及抗体开发外,还涉及到脂质体、DNA、RNA、化合物、病毒以及纳米颗粒等。BLI技术相较于传统的SPR技术,分析样本不受体积大小的限制(SPR技术的有效信号检测范围通常在距离芯片表面150纳米之内)。因此Octet系统可以直接检测超大体积的样本,如病毒颗粒、细菌甚至细胞等。

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3

 以检测方式分类

在过去的一年中,陈老湿多次在微信中提到应用Octet进行多分子的相互作用分析。因此Octet除了经典的kon、koff、KD等动力学表征分析外,还可以用以检测样品浓度以及多分子竞争实验。新版的HT软件(Ver.12)有专门的模块来帮助用户进行实验设置和数据分析,欢迎大家有机会的时候尝试一下。

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诺奖获得者教你做分子互作竞争实验

4

  关于新冠的CNS 

新冠是2020年人类公共卫生的最大威胁,也影响了我们生活的方方面面。有29篇关于新冠基础研究、中和抗体以及疫苗研发的文章中可以看到Octet互作分析仪的身影。

能为战胜COVID-19贡献一份绵薄之力,陈老湿真的很欣慰啊。

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老湿曰

为啥子好文章能犹如滔滔江水,连绵不绝;又如黄河泛滥,一发而不可收拾呢?

Summary

  Octet提供的支持 

数据可靠

是非标记技术,直接定量表征分子相互作用(可以检测结合和解离平衡常数);

耐受粗样品

采用专利浸入即读模式,无惧样品堵塞,可直接检测粗样品以及含高粘度、高浓度有机溶剂的样品;

应用广泛

可检测小分子、蛋白、RNA/DNA、病毒细菌细胞等各种生物分子与颗粒,除亲和力/动力学表征外,亦可进行浓度测定、竞争实验等方式;

简便易用

使用简便,检测迅捷,对初学者非常友好,耗材和维护成本低;

检测速度快

多通道平行检测,无需复杂的前处理,快速获得数据分析结果。

陈老湿在此要特别感谢我们中国的Octet用户,真心希望大家能通过Octet得到满意的数据,发表高质量的文章。

2020中国用户CNS一览:

▲ 向上滑动

A noncompeting pair of human neutralizing antibodies block COVID-19 virus binding to its receptor ACE2.Science高福院士组新冠中和抗体发现,Octet主要用于粗样品中抗体亲和力筛选。

Potent neutralizing antibodies against SARS-CoV-2 identified by high-throughput single-cell sequencing of convalescent patients’ B cells. Cell中国医学科学院实验动物研究所,北京大学等关于新冠中和抗体发现。Octet主要用于竞争实验,观察抗体是否结合S蛋白同一表位。

A human neutralizing antibody targets the receptor binding site of Sars-Cov-2. Nature微生物所严景华,高福组新冠中和抗体发现。Octet主要用于竞争实验,观察抗体是否结合S蛋白同一表位。

DNA of neutrophil extracellular traps promotes cancer metastasis via CCDC25. Nature中山大学等。揭示了中性粒细胞胞外诱捕网中的DNA通过特殊蛋白分子促进癌症转移的新型分子机制,Octet主要用于DNA和蛋白质的亲和力检测。

A thermostable mRNA vaccine against COVID-19.Cell中国军事医学科学院、中国食品药品检定研究院、苏州艾博生物科技有限公司等,新冠mRNA疫苗研发,Octet用来检测mRNA疫苗表达产物与ACE2的亲和力。

N6-methyladenine in DNA antagonizes SATB1 in early development.Nature清华大学李海涛组,DNA修饰与早期胚胎发育中大染色质域之间的联系。Octet用来检测蛋白和DNA的亲和力。

A neutralizing human antibody binds to the N-terminal domain of the Spike protein of SARS-CoV-2.Science军事医学院陈薇组新冠中和抗体发现。Octet QKe用来检测抗体和靶点的亲和力。

Structural insight into arenavirus replication machinery. Nature微生物所高福/施一组首次解析了砂粒病毒科聚合酶结构。Octet用来检测RNA聚合酶和RNA的亲和力。

童鞋们,甭犹豫了,开动你手中的Octet,向着CNS进发吧!

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