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溶剂化参数计算——ACD/Absolv

ACDLabs CN
2022.4.26

作者 ACD

TA的动态

概述

溶剂化参数是溶质的基本特征,是决定许多生物特性的关键因素。在某些情况下,将感兴趣的性质与溶剂化参数关联起来搭建的简单模型(Abraham方程),足以快速预测新化合物对应的性质。

Absolv模块是Pharma Algorithms公司(目前已被ACD/Labs公司收购)和M. H. Abraham教授合作开发的计算模块。它基于Abraham方程计算各种溶剂相关的性质,并预测这些计算所需的Abraham溶剂化参数。这个模块目前已经整合到ACD/Percepta软件中。

模块介绍

Absolv

Absolv模块计算的溶质属性如下,通常被称为Abraham溶剂化参数:

Overall solute H-Bonding acidity:

总溶质H键酸度-α2H (A)

Overall solute H-Bonding basicity:

总溶质H键碱度-β2H ( B )和β2O (Bo)

Partitioning coefficient between gaseous phase and hexadecane:

气相与十六烷烃之间的分配系数-log L16 (L)

Polarity / polarizability:

极性/极化率-π2H (S)

Excessive molar refraction:

过度的摩尔折射-R2 ( E )

McGowan characteristic volume:

麦高恩特征体积- Vx (V )

原子上的颜色强度表示每个原子或结构片段对所选参数的贡献程度 ;

计算的溶质的Abraham溶剂化参数结果 ;

软件会从训练集中挑选出5个最相似的结构及对应的实验值供用户参考 。

Absolv Equations

用户可以在Absolv equation界面,从250多个预定义的Abraham方程中计算出各种溶剂-溶剂或气体-溶剂的分配系数。 或者,可以输入任何使用预测的Abraham溶溶剂化参数的自定义方程。

使用选定的方程所得到的计算结果;

可将相应方程的结果切换为“不可见”;

所有的溶剂化方程都按其类型分组,可选择适当的选项卡进行切换查看;

溶剂化属性的名称;

用来计算特定性质的方程;

对相应方程的注释;

参考文献;

滚动选定组中所有可用的方程

在“结果”窗格中切换相应方程的结果可见/不可见

单击以打开方程管理器窗口,如下所示:

方程管理器允许定义新的、编辑或删除现有的自定义Abraham方程(如下图所示),以及查看所有预定义的方程。

新输入的方程式出现在方程式管理器和方程式窗格的相应类别下:  

后台数据库

Absolv数据库包含了7885个化合物以及由M. H. Abraham教授和其同事确定的溶剂化参数的实验值,可供用户轻松查阅。主要参考文献如下:  

Abraham, M. H., Grellier, P. L., Prior, D. V., Duce, P. P., Morris, J. J., and Taylor, P. J., J. Chem. Soc. Perkin Trans 2, 1989, 699.

Abraham, M. H., Grellier, P. L., Prior, D. V., Morris, J. J., and Taylor, P. J., J. Chem. Soc. Perkin Trans 2, 1990, 521.

Abraham, M. H., Whiting, G. S., Doherty, R. M., and Shuely, W. J., J. Chromatogr., 1991 (587), 213-228.

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