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Western成像,既要高、中、低丰度蛋白都被检测到,又要线性度好不过曝,能做到吗?

赛默飞生命科学
2023.6.06

既要,又要能成为现实吗?

 

理想的Western成像:不论高低丰度的目标蛋白均有清晰条带,没有过曝,线性度好,背景干净。

现实的Western成像:由于中丰度到高丰度的蛋白质在western上比低丰度的蛋白质具有更高的信号,曝光时间过短 – 中高丰度蛋白条带清晰,但是低丰度蛋白质条带隐隐约约,增加曝光时间 – 低丰度蛋白条带清楚了,但是中、高丰度蛋白质的信号饱和,条带变得又黑有宽,好像蜡笔小新的眉毛!

 

怎么办呢?

 

除了不断优化曝光时间,还有什么可以省(yi)时(lao)快(yong)速(yi)的方法吗?

 

可以试一试iBright 成像系统新升级的功能:Smart Range HDR!

线性度怎么样呢?

图1. Smart Range HDR功能将短曝光和长曝光结合到单个HDR图像中,增加了线性动态范围。采用Smart Exposure可快速获取条带,但是低丰度不明显;长期曝光可以增加低丰度蛋白的条带深度,但是中、高丰度蛋白出现了过曝(红色表示过曝),Smart Rang HDR将两者结合起来,既能获得清晰的低丰度蛋白,又能减少中、高丰度蛋白的过曝,其线性度更好。

图2. 与Smart Exposure功能相比,Smart Range HDR功能将p23的检测极限提高了4倍。HeLa裂解液在样品缓冲液中依次1:1稀释(从20 μg到10 ng),制备SDS-PAGE,在Invitrogen™Novex™WedgeWell™4-20% tris -甘氨酸凝胶上电泳。将蛋白转移到硝化纤维素膜上,检测p23。使用Smart Exposure和Smart Range HDR功能在iBright成像系统上进行western blot成像。通过(A)视觉评估和(B)有多少数据点落在线性动态范围内对图像进行比较。图中省略了20 μg的数据点,因为它落在两个参数的线性范围之外。

实际用起来,又有哪些帮助呢?

图3. 与Smart Exposure功能和长时间曝光(过度曝光)图像(未示出)相比,Smart Range HDR拍摄的图像具有更多细节,最低信号带现在可在背景上区分,最高信号带不饱和。A431细胞未处理对照, hEGF处理, hEGF加PD168393(急性EGFR抑制剂)处理。细胞裂解后进行SDS-PAGE检测。从每个样品中抽取10 μg,分三次加入两个12孔Novex WedgeWell 4-20% tris -甘氨酸凝胶中。将蛋白转移到硝化纤维素膜上,然后切成3条相同的条带,每个条带具有相同的样品布局,用Pierce™Clear Milk Blocking Buffer孵育,然后检测EGF受体途径和p23(管家蛋白)中的4种不同的磷酸化蛋白。四种不同的印迹与HRP二抗孵育,洗涤,然后使用SuperSignal West Dura发光液。(A)利用smart Exposure和Smart Range HDR功能,在iBright FL1500成像系统上进行成像。(B) 磷酸化蛋白数据归一化使用管家蛋白p23进行。

在上面的例子中(图3),与单独使用Smart Exposure功能捕获印迹信号相比,Smart Range HDR功能显著提高了对低表达磷酸化蛋白的检测。SmartRange HDR图像具有更多细节,最低信号带在背景之上可区分,最高信号带不饱和。结果的扩展可以实现更可靠的整体数据解释。

需要注意的是:蛋白样品种类万千,不是所有的样品都适合采用Smart Rang HDR。如果你的目标蛋白丰度差异不大,Smart Exposure就能给出准确的曝光时间,且能迅速完成曝光,就没有必要动用Smart Rang HDR功能啦。

想要试用下iBright成像仪的这个功能

可以扫码联系我们👇🏻

希望你的蛋白也能被“看”的清清楚楚!

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