近日,墨卓生物首发MobiCube®高通量单细胞兔V(D)J产品,这是继MobiCube®高通量单细胞V(D)J试剂盒、3’转录组V2.0试剂盒之后,墨卓在半年内推出的第三款全新产品,是墨卓快速产品开发的能力和完整生产能力建设完成后快速转产的能力又一次体现。据悉,这是全球范围内第一款兔V(D)J商业化试剂盒,可广泛用作临床诊断,疫苗研发,免疫学研究,药物研发等。
另外,该试剂盒适配MobiNova®-100高通量单细胞建库系统,该系统已经在包括诺禾致源、欧易生物、博奥晶典在内的多家科研服务商、数百个终端研究机构广泛应用,数据质量稳定可靠、取得了客户的一致认可,兔V(D)J试剂盒的发布将为客户提供更全面、综合的研发解决方案。
单克隆抗体常见筛选方法为杂交瘤技术和噬菌体展示技术,但两项技术均存在筛选效率低、筛选周期过长的不足,这也是限制抗体开发速度的因素之一。
如何缩短周期,提高抗体筛选效率是加速兔抗体开发的关键。高通量单细胞V(D)J全长测序可一次完成上万单细胞的mRNA捕获,单次实验即可获得数万B细胞的V(D)J全长序列,直接对接下游抗体序列合成,进而显著缩短抗体筛选周期及提高筛选效率。该技术也因此获得很多抗体筛选CRO公司的青睐。
去年,墨卓生物推出针对人、小鼠的MobiCube®高通量单细胞的V(D)J试剂盒。今年,我们倾听客户声音,开发出针对兔的MobiCube高通量单细胞V(D)J试剂盒,以助力高亲和力和高特异性兔抗体开发。
MobiCube®高通量单细胞V(D)J试剂盒(兔)基于微流控技术,可同时对每个细胞完成mRNA分子的捕获,并在此过程中给捕获的mRNA分子打上细胞特异性分子标签。完成mRNA分子捕获后,通过逆转录和NGS文库构建,即可获得单个细胞的转录组信息。
与此同时,以逆转录获得的cDNA为模板,可通过多重PCR或巢式PCR获得每个细胞内的全长VDJ序列信息。
墨卓生物高通量单细胞V(D)J(兔)测序平台,可结合流式细胞术/免疫磁珠分选等方法,先从兔PBMC或者脾脏等样本中分选得到B细胞,再用墨卓的高通量单细胞V(D)J测序平台,完成单B细胞的VDJ测序,一周内即可快速获得候选抗体序列。
当然作为高通量单细胞平台,您也可以获得单细胞悬液后,直接进行高通量单细胞转录组文库构建及测序。因为通过转录组信息,我们也可以帮您高效鉴定样本中的B细胞,同时给出对应的VDJ序列信息。
模拟真实场景的数据表现
为了模拟流式细胞术/免疫磁珠分选后得到细胞数较少的真实场景,我们将投入细胞量调整至8000个,进行本次测试,对于客户关心的B细胞也重点进行了测试。
在此情况下,通过5端转录组测序识别到4,002个细胞,中值基因数在1,375。
细胞注释图
在此样本中捕获B细胞2,710个,其中重轻链成功配对率达到85.6%。这些细胞我们都可以拿到全长的V(D)J序列信息,构建抗体表达载体,用于生产抗体。
BCR映射图
令人安心的稳定性
我们同样在投入低细胞的情况下,进行了稳定性测试。将一份PBMC样本一分为二,在两台MobiNova®-100仪器上进行测试。结果显示,两组实验的细胞分群图高度重叠,在投入5000个细胞的情况下,捕获细胞数为2301,2501,中值基因数分别为1006,1008。从细胞分群、捕获细胞数、中值基因数上均表现出高重复性。
2次独立测试,兔PBMC样本5端转录组图谱高度重复
独立测试1 独立测试2
VDJ数据分析结果也显示,两组测试的BCR富集效果高度可重复,同时, BCR的重轻链配对率均达到80%以上。
上海欧易生物医学科技有限公司(简称:“欧易生物”),成立于2009年,经过十多年稳健发展,已经成长为拥有“晶准生物”“鹿明生物”“青岛欧易”三家全资子公司,近600名员工的生物科技领域集团型企业。
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