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如何进行质谱化合物参数优化?

基泰生物
2023.11.28

如何进行质谱化合物参数优化

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化合物参数优化

描述如何用针泵连续进样(10ul/min),在Manual Tuning 窗口下优化化合物参数。

找母离子:Q1 MS全扫描

A、选择你的 project;双击 Navigation Bar 下的 Manual-Tuning;从 Scan Type 下拉菜单中选择:Q1 Scan (Q1);选择极性:Positive(正离子)、Negative(负离子);勾选Center/with选项;设置采集时间Duration: 5min;在表格中Center(Da)栏填入待优化化合物的分子量,With(Da)栏填6,Time(sec)填1;左侧Source/Gas项用以下推荐值:CUR 10,IS:5500(正离子) 或-4500(负离子),TEM0,GS1 15,GS2 0,ihe on;Compound项用以下推荐值:DP 60,EP 10或默认值;

B、运行针泵(10ul/min),

找子离子:Product Ion Scan(MS2)

A、在当前方法文件的Scan Type下选择 Product Ion Scan (MS2);去除Center/with选项;在Product of栏填入上一步找到的母离子的准确分子量;在表格中start(Da)栏填50,stop(Da)栏填入质量大于母离子分子量即可,Time(sec)填1;检查Source/Gas项是否与Q1扫描时相同(CAD 默认值即可);Compound项设定DP 60, EP 10或默认值,CE 5,CXP 15或默认值;

B、

优化离子对参数:MRM

A、在当前方法文件的Scan Type下选择 MRM;在表格中Q1栏填母离子分子量,Q3(Da)栏子离子分子量,Time(msec)填50,ID栏填化合物名称(信号强的离子对名称后空格加1,信号弱的为2),每个离子对填一行;检查Source/Gas项是否与Q1扫描时相同(CAD 默认值即可)

B、

C、

D、

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