T/SZGIA 2-2016由中国团体标准 CN-TUANTI 发布于 2017-01-20,并于 2017-01-20 实施。
T/SZGIA 2-2016在国际标准分类中归属于: 07.100.01 微生物学综合。
本标准规定了检测对象、检测要求、样品采集、保存与运输的要求;检测步骤包括实验室必须要满足的条件;以及DNA的质量判定标准;文库构建以及高通量测序流程;数据信息分析和数据质量控制的要求。其中数据质量控制规定了质量要求和数量要求,质量要求测序完成后,每个DNA样品对应的有效可用数据质量值应符合如下要求:Q20≥90%,该样品测序结果90%以上的碱基质量值大于20;Q30≥80%,该样品测序结果80%以上的碱基质量值大于30。而数量要求:为了完成后续物种注释,功能分析等数据分析步骤,要求每个样品测序短序列数目(
后伯克利分校的研究人员Kevin Chen和Lior Pachter将宏基因组定义为“应用现代基因组学的技术直接研究自然状态下的微生物的有机群落,而不需要在实验室中分离单一的菌株”的科学。宏基因组鸟枪法测序,能得到整个环境微生物群落的遗传信息,而人体微生物组,尤其是人肠道微生物组,基因数量远超过宿主,更是被称为人体“第二套基因组”。...
2. 医院内细菌和真菌感染实验室诊断。3. RNA提取,宏转录组文库的制备和测序。对于每个样本,提取总RNA,并定量浓度。纯化的RNA样品在DNBSEQ-T7平台上进行预处理、DNA纳米球文库构建和高通量转录组测序。4. 从宏转录组数据中识别并去除人类RNA序列。5. 从宏转录组数据中识别并去除微生物核糖体RNA序列6. SARS-CoV-2感染住院患者病毒群落特征分析。7....
微生物群(Microbiota)是指特定时间及特定生境中所有微生物有机体的总称,包括非细胞结构的病毒、原核生物中的细菌和古菌及真核细胞微生物。微生物组(Microbiome)是指特定时间及特定生境中微生物群所包含的基因序列(含同源序列总和)。近年来,针对环境微生物的研究,逐渐成为各个领域的研究热点。目前基于环境微生物的测序策略主要包括微生物多样性、宏基因组及宏转录组等多个产品。...
为评估BGISEQ-500的宏基因组测序应用性能,该研究团队收集并提取了20例健康成年人粪便DNA,采用BGISEQ-500的SE100测序策略完成该20例样本的深度宏基因组测序。...
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