可用甲酰胺代替 SDS/蛋白酶 K 将纯化的噬菌体颗粒去除外壳。这种方法虽然不是很有效,但在某种意义上它比以前的操作方法更快。本实验来源「分子克隆实验指南第三版」黄培堂等译。
实验方法原理 | 可用甲酰胺代替 SDS/蛋白酶 K 将纯化的噬菌体颗粒去除外壳。这种方法虽然不是很有效,但在某种意义上它比以前的操作方法更快。 |
---|
实验材料 | 限制性内切核酸酶λ 噬菌体颗粒 |
---|
试剂、试剂盒 | EDTA乙醇甲酰胺NaClTETris-Cl |
---|
仪器、耗材 | 琼脂糖凝胶硼硅酸盐巴斯德吸管 |
---|
实验步骤 | 一、材料
1. 缓冲液和溶液
EDTA ( 0.5 mol/L,pH 8.0)
乙醇
甲酰胺,去离子
NaCl ( 5 mol/L)
TE ( pH 7.6 和 pH 8.0)
Tris-Cl ( 2 mol/L,pH 8.5)
2. 酶和缓冲液
限制性内切核酸酶
3. 凝胶
琼脂糖凝胶(0.7%),用 0.5X TBE,含 0.5 μg/ml 溴化乙锭
4. 专用设备
硼硅酸盐巴斯德吸管(密封)或 Shepherd 钩
5. 载体和菌株
λ 噬菌体颗粒
二、方法
1. 如果必要,按方案 11 步骤 1~4 所述将 CsCl 从噬菌体颗粒样品中除去。
2. 测定噬菌体颗粒样品的体积。
3. 加入 0.1 倍体积的 2 mol/L Tris ( pH 8.5)、0.05 倍体积的 0.5 mol/L EDTA(pH 8.0)和 1 倍体积的去离子甲酰胺,37℃ 温育 30 min。
在温育过程中,牛奶状的噬菌体颗粒悬浮液变清成透明溶液。
4. 加入 1 倍体积(等于步骤 3 中的终体积)的 H2O 和 6 倍体积(每倍体积等于步骤 3 中的终体积)的乙醇。
5. 将 λ 噬菌体 DNA 沉淀黏附于封口的硼硅酸盐巴斯德吸管或 Shepherd 钩的末端,转移至含 70% 乙醇的微量离心管中。
6. 短暂离心(10 s ) 收集 DNA 沉淀。
避免长时间的离心,否则将使 DNA 太紧密而难以溶解。
7. 去上清,将离心管打开于实验台放置数分钟以便使乙酵挥发。加入 300 μl TE,通过拍离心管壁使潮湿的 DNA 沉淀重新溶解。尽量避免使用涡旋振荡。
8. 加入 6 μl 5 mol/L NaCl 和 750 μl 乙醇重新沉淀 DNA,收集沉淀,如步骤 6 和 7 所述重新溶解。
9. 采用适当大小的分子质量标准,经 0.7% 琼脂糖电泳分析未消化的或已用适当限制酶切割的部分 DNA(0.5 μg),检査噬菌体 DNA 的完整性。
10. 将噬菌体 DNA 于 4℃ 保存。 |
---|