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CDNA第一条链的合成 (20微升体系)

2019.10.27
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zhaochenxu

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CDNA第一条链的合成 (20微升体系)
一、  按以下顺序加样于500微升EP管中
1. RNA 5 UL
2. Oligo Dt 1 UL
3. dNTP 1 UL (浓度10mM)
4. DEPC水 5UL (为试剂盒中配套的水)
共12UL混匀离心——70℃水浴5分钟——冰浴2分钟(片刻)
二、  继续按以下顺序加样
1. 5×BUFFER 4 UL
2. 0.1MDTT 2UL
3. RNase Out* 1UL
混匀——37℃ 2分钟
三、再加M-MLV* 1 UL
共20UL 混匀37 60分钟——70℃ 15分钟
四、CDNA 合成完毕,4℃冰箱保存
“*”标识为反应酶,需现用现取,千万不要长时间常温放置,防止酶失活
五、普通RT-PCR 反应
PCR反应体系确定标准:
Mg2+ 1.5 mmol/L
Kcl 50 mmol/L
dNTPs 200umol/L
引物 1 umol/L
DNA聚合酶 1-5unit
模版DNA 1pg--1ug
1目的:验证引物的正确性,为实时定量PCR做准备;若目的基因条带清楚,无杂带,可进一步制作目的基因标准曲线
2准备工作:根据引物不同,确定不同的反应体系,做好标记
3现以本人目的基因为例说明如下:
ETS、HGF、CMET、内参GAPDH
每一份CDNA样品需分4管( PCR仪专用EP管)
⑴ ETS_1
⑵ HGF
⑶ CMET
⑷ GAPDH
每一反应体系需按下列体积加样
模版CDNA 2UL
10×Buffer 2UL
dNTP 2UL(浓度2.5mM)
引物上游 1UL
引物下游 1UL
Tap酶 1UL (该酶浓度 15u/ul)
DEPC水 11UL
共20UL反应体系
如需配制4个反应体系,先把公用部分按4倍加入500UL EP管中,再分装为4管
DEPC水 11UL × 4 == 44
模版CDNA 2UL × 4 == 8
10×Buffer 2UL × 4 == 8
dNTP 2UL× 4 == 8
共68UL,分装为4管,每管17UL


六、琼脂糖普通凝胶电泳,验证PCR反应效果
1.配制琼脂糖普通凝胶(1.5%)
琼脂糖 0.45g
1×TBE 30ml
微波炉中火加热约1分钟,至琼脂糖TBE混合液变清澈即可
待稍微冷却后加入

丁香通
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