质谱仪作为目前较常用的对纯物质鉴定的工具，在生产生活中具有着重要的地位。一般常见的质谱仪具有全扫描、单离子监测、选择离子扫描、中性碎片丢失扫描等。以下收集了一些质谱扫描模式相关信息，以便更具体了解质谱：
1.全扫描 Full Scan
全扫描是指在进行质谱采集时，扫描一段自己来设定的范围，然后覆盖对被测化合物的分子离子以及碎片离子的质量，一般想要得知未知物质的分子量以及相应的所有的碎片离子，都会进行全扫描，通过扫描得到的全谱，进行相应的谱库检索从而得到未知物质的相应信息。
2.单离子监测 SIM
单离子监测也称选择离子扫描，是指针对一级质谱而言，进行只扫一个离子的模式，并不是连续扫描某一范围内的质量，而是通过设定有针对的扫描某几个选定的质量。一般对已知物质，为避免其他离子对实验的干扰并提高某一离子灵敏度，通常仅需要扫描一个离子。一般用于化合物检测和复杂混合物中杂质的定量扫描检测。
3.中性碎片丢失扫描 Neutral Loss
在进行中性碎片丢失扫描时，质量分析器选择所有离子进入碰撞室，与碰撞室内的碰撞气体发生碰撞诱导裂解，另一个质量分析器以与前一个质量分析器固定质量差联动扫描，检测丢失该固定质量中性碎片的离子对，得到中性碎片质谱。
4.选择反应监测 SRM
选择反应扫描也称作选择反应监测，是一种针针对二级质谱或多级质谱的某两级之间的扫描模式。当母离子选一个离子发生碰撞后，从形成的子离子中也只选一个离子。选择反应监测由于两次都只选单离子，因此能排除掉大部分的干扰信息，在相对复杂且基质背景高的样品检测中，其灵敏度信噪比会较高，抗背景排干扰的能力也较强。
5.多反应扫描 MRM
多反应扫描既多反应监测，是在进行多个化合物检测过程中，多个选择反应监测一起进行。因此多反应扫描的特点与选择反应监测特点相似，因此在实际操作生产中并不会对选择反应监测与多反应监测进行区分，在实验过程中只要同时进行多个选择反应监测便是多反应监测了，彼此之间区分仅是数量上的分别。
在一般进行质谱实验的过程中，对于检测物质定性扫描时，因为想观测到更多的离子因此会选择全扫描模式。当定量检测时，一般会想要提高已知的信息强度在复杂的基质环境下的测量，会选择单离子监测、选择反应监测以及多反应监测等。
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