载体两性电解质pH梯度等电聚焦电泳仪是利用蛋白质分子或其它两性分子的等电点不同，在一个稳定的、连续的、线性或非线性的pH梯度中进行分离，具有以下特点：
一、优点：
1、分辨率高，区带清晰、窄。
2、加样部位自由，重现性好。
3、可测定蛋白和多肽的等电点。
二、缺点：
1、载体两性电解质合成过程复杂，影响蛋白质点的位置，从而影响重复性。
2、负极漂移现象使pH梯度不稳定。
3、负极漂移现象使碱性蛋白质无法聚焦。
4、凝胶灌制重复性差，影响结果重复性。
5、需无盐溶液，不适用于在等电点不溶解或发生变性的蛋白质。
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