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蛋白酶解的首选变性剂——RapiGest SF(一)

2020.6.29
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王辉

致力于为分析测试行业奉献终身

在生物药肽图分析、蛋白质修饰分析、蛋白质组学研究等诸多工作中,蛋白质的变性与酶解是样品处理的必经之路。RapiGestTM SF正是在这个实验步骤中,用以辅助蛋白酶解的变性试剂[1,2,3]。RapiGest SF有以下优点:

■ 综合水相、有机相溶液条件下,最高效的辅助酶解变性剂。

■ 作用过程中,不对蛋白造成副反应化学修饰。

■ 操作简单、全面适应液质分析方法。

■ 常规操作浓度对胰蛋白酶活性无抑制。

■ 可大大缩短酶解反应时间。

■ 对各种蛋白酶、肽-N糖苷酶等多种酶解过程都适用。

在蛋白质质谱分析的大部分工作中,常常需要将蛋白质酶解为多肽进行分析。但蛋白质结构是以三维结构的形式存在的,为了将蛋白高级结构内部的酶切位点暴露于蛋白酶的作用下,首先需要对蛋白进行变性,使蛋白舒展开。John R. Yates教授领导的团队对各种变性剂中的辅助酶切效果进行了充分比较,其中RapiGest SF的表现最为优秀(图1)[4]。仔细观察图1还可以发现,在实验结果中,较为常用的尿素辅助酶切效率较差。这是由于尿素对胰蛋白酶活性的抑制作用较大。实验人员有时会采取使用尿素进行蛋白后,将反映溶液稀释10倍,再加入胰蛋白酶的方法,以降低尿素浓度到1M以下,减少其对胰蛋白酶的抑制。但是,面对微量的生物蛋白样本,稀释后的体系,会大幅度降低样品浓度,限制了后续的分析工作。此外,尿素在对蛋白变性的过程中,还会对蛋白进行一定的化学修饰,如氨基甲酰化。副反应的发生对于多肽鉴定、组学水平蛋白定量会造成一定的影响与误差。而使用RapiGest SF无副反应的问题,正常使用浓度下(0.1%)对胰蛋白酶活

性也无影响(表1)。


图1. Tris水相缓冲体系下各种变性剂的辅助酶切效果比较。样品为mammalian cell lysate cytoplasmic fraction蛋白。

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检测基于胰蛋白酶诱导N-α-苯甲酰-L-精氨酸乙基乙酯(BAEE)水解。将0.5微克胰蛋白酶加入1mL 50mM的碳酸氢铵溶液中(pH 7.9,0.2 mM BAEE)。检测△BAEE在253 nm下的吸收值(5分钟内的斜率)。


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