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重组质粒(dna recombinant plasmid)的连接、转化及筛选-2

2020.9.08
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王辉

致力于为分析测试行业奉献终身

第二节 材料、设备及试剂

一、 材料

外源DNA 片段: 自行制备的带限制性末端的DNA 溶液,浓度已知; 载体DNA : pBS质粒(Ampr ,lacZ),自行提取纯化,浓度已知; 宿主菌: E. coli DH5α,或JM系列等具有α-互补能力的菌株。

二、 设备

恒温摇床,台式高速离心机,恒温水浴锅, 琼脂糖凝胶电泳装置, 电热恒温培养箱,电泳仪无菌,工作台, 微量移液枪,eppendorf管。

易生物仪器库:http://www.ebioe.com/yp/product-list-42.html


易生物试剂库:http://www.ebioe.com/yp/product-list-43.html

三、 试剂

1、连接反应缓冲液(10×):0.5mol/L Tris・Cl (pH7.6),100mol/L MgCl2,100mol/L 二硫苏糖醇(DTT)(过滤灭菌),500μg/ml 牛血清清蛋白(组分V.Sigma 产品)(可用可不用),10mol/L ATP(过滤灭菌)。

2、T4 DNA 连接酶(T4 DNA ligase);购买成品。

3、X-gal储液(20mg/ml): 用二甲基甲酰胺溶解X-gal配制成20mg/ml的储液, 包以铝箔或黑纸以防止受光照被破坏, 储存于-20℃。

4、IPTG储液(200mg/ml): 在800μl蒸馏水中溶解200mg IPTG后,用蒸馏水定容至1ml,用0.22μm滤膜过滤除菌,分装于eppendorf管并储于-20℃。


5、麦康凯选择性培养基(Maconkey Agar):取52g麦康凯琼脂加蒸馏水1000ml,微火煮沸至完全浴解,高压灭菌,待冷至60℃左右加入Amp储存液使终浓度为50mg/ml,然后摇匀后涂板。

6、含X-gal和IPTG的筛选培养基:在事先制备好的含50μg/ml Amp的LB平板表面加40ml X-gal储液和4μlIPTG储液,用无菌玻棒将溶液涂匀,置于37℃下放置3-4小时,使培养基表面的液体完全被吸收。

7、感受态细胞制备试剂: 见第三章。

8、煮沸法快速分离质粒试剂: 见第一章。

9、质粒酶及电泳试剂: 见第二章。

第三节 操作步骤

一、 连接反应

1、取新的经灭菌处理的0.5ml eppendorf管, 编号。

2、将0.1μg载体DNA 转移到无菌离心管中,加等摩尔量(可稍多)的外源DNA 片段。

3、加蒸馏水至体积为8μl,于45℃保温5分钟,以使重新退火的粘端解链。将混和物冷却至0℃。

4、加入10×T4 DNA ligase buffer 1μl, T4 DNA ligase 0.5μl, 混匀后用微量离心机将液体全部甩到管底,于16℃保温8-24小时。

同时做二组对照反应,其中对照组一只有质粒载体无外源DNA ;对照组二只有外源DNA 片段没有质粒载体。
二、 E. coli DH5α感受态细胞的制备及转化

每组连接反应混和物各取2μl转化E. coli DH5α感受态细胞。具体方法见第三章。

三、 重组质粒的筛选

1、每组连接反应转化原液取100μl用无菌玻棒均匀涂布于筛选培养基上,37℃下培养半小时以上,直至液体被完全吸收。

2、倒置平板于37℃继续培养12-16小时,待出现明显而又未相互重叠的单菌落时拿出平板。

3、放于4℃数小时,使显色完全(此步麦康凯培养基不做)。

不带有pBS质粒DNA 的细胞,由于无Amp抗性,不能在含有Amp的筛选培养基上成活。带有pBS载体的转化子由于具有β-半乳糖苷酶活性,在麦康凯筛选培养基上呈现为红色菌落。在X-gal和ITPG培养基上为蓝色菌落。带有重组质粒转化子由于丧失了β-半乳糖苷酶活性,在麦康凯选择性培养基和x-gal和ITPG培养基上均为白色菌落

四、 酶切鉴定重组质粒

用无菌牙签挑取白色单菌落接种于含Amp 50μg/ml的 5ml LB液体培养基中,37℃下振荡培养12小时。使用煮沸法快速分离质粒DNA 直接电泳,同时以煮沸法抽提的pBS质粒做对照,有插入片段的重组质粒电泳时迁移率较pBS慢。再用与连接未端相对应的限制性内切酶进一步进行酶切检验。还可用杂交法筛选重组质粒。

[注意] 1、DNA 连接酶用量与DNA 片段的性质有关,连接平齐末端,必须加大酶量,一般使用连接粘性末端酶量的10-100倍。


2、在连接带有粘性末端的DNA 片段时,DNA 浓度一般为2-10mg/ml,在连接平齐末端时,需加入DNA 浓度至100-200mg/ml。

3、连接反应后,反应液在0℃储存数天,-80℃储存2个月,但是在-20℃冰冻保存将会降低转化效率。

4、粘性末端形成的氢键在低温下更加稳定,所以尽管T4 DNA 连接酶的最适反应温度为37℃,在连接粘性末端时,反应温度以10-16℃为好,平齐末端则以15-20℃为好。

5、在连接反应中,如不对载体分子进行去5'磷酸基处理,便用过量的外源DNA 片段(2-5倍),这将有助于减少载体的自身环化,增加外源DNA 和载体连接的机会。

6、麦康凯选择性琼脂组成的平板,在含有适当抗生素时,携有载体DNA 的转化子为淡红色菌落,而携有带插入片段的重组质粒转化子为白色菌落。该产品筛选效果同蓝白斑筛选,且价格低廉。但需及时挑取白色菌落,当培养时间延长,白色菌落会逐渐变成微红色,影响挑选。

7、X-gal是5-溴-4-氯-3-吲哚-b-D-半乳糖(5-bromo-4-chloro-3-indolyl-b-D- galactoside)以半乳糖苷酶(b-galactosidase)水解后生成的吲哚衍生物显蓝色。IPTG是异丙基硫代半乳糖苷(Isopropylthiogalactoside),为非生理性的诱导物,它可以诱导lacZ的表达。

8、在含有X-gal和IPTG的筛选培养基上,携带载体DNA 的转化子为蓝色菌落,而携带插入片段的重组质粒转化子为白色菌落,平板如在37℃培养后放于冰箱3-4小时可使显色反应充分,蓝色菌落明显。


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