【注意事项】
基因组DNA分子量大,所有操作必须轻柔,酚/氯仿对皮肤有腐蚀作用,应该戴手套操作。
二、RNA的制备
【实验目的】
1.理解生物细胞中RNA制备方法的原理。
2.熟悉组织细胞中RNA制备的基本操作。
(一)细胞总RNA的提取
1.异硫氰酸胍法
【实验原理】
异硫氰酸胍法提取细胞总RNA是目前常用的提取方法,其基本原理是:异硫氰酸胍 (GuSCN)是一种强的蛋白质变性剂,不仅能使细胞裂解,同时还能有效地抑制细胞内源性RNA酶的活性,通过有机溶剂的分步抽提,最终可获得纯度较高的细胞总RNA。
【实验对象】
新鲜哺乳动物组织或细胞
【实验试剂与器材】
(1)GuSCN缓冲液:
4 M异硫氰酸胍(GuSCN) ,25mmol/L 柠檬酸(pH7.0),0.5% 十二烷基肌氨酸钠(SLS)。配制方法:先称取GuSCN加少量双蒸水溶解,然后加入其余成分,65℃加热使其充分溶解,4℃保存备用。
(2)GuSCN/25mmol/L β-巯基乙醇溶液:
将0.36ml β-巯基乙醇溶于200ml GuSCN缓冲中,4℃保存备用。
(3)2M NaAc (pH 4.0)
(4)0.1% DEPC-H2O:将0.1 ml DEPC加入100ml双蒸水中,室温摇晃12~24小时,然后15磅高压15min(注意:若用此水处理容器,可以不用高压处理)
(5)氯仿:异戊醇 (49:1, v/v)
(6)DEPC-H2O饱和酚:
将DEPC-H2O和酚1:1混合,室温摇晃1小时,然后静止使其分层,吸除水相,再加入DEPC-H2O重复一次,此即DEPC-H2O饱和酚。
(7) 无水乙醇
(8) 75%冰冷乙醇
【实验方法与步骤】
(1)取离心洗涤后的1×106培养细胞或相当量的研磨后的组织,加入200?滋 l GuSCN/25mM)-巯基乙醇溶液,剧烈震荡使细胞裂解,此时溶液变黏稠;
(2)加入下列成分:2M NaAc (pH4.0) 25?滋l,DEPC-H2O饱和酚240?滋l,氯仿:异戊醇 (49:1,v/v) 50?滋l,剧烈震荡10秒钟,冰浴15min;
(3)4℃,10,000×g离心30min,使其充分分层,水相应透明无任何混浊 [注:RNA在上 层水相,DNA和蛋白质在中间相和酚相中];
(4)将上层水相转移至另一离心管中,加入2.5倍体积的无水乙醇,-20℃沉淀 30min,4℃,10,000×g离心20min;
(5)弃上清,加入100?滋l GuSCN缓冲液将RNA沉淀溶解,然后加入200?滋l无水乙醇,-20℃沉淀30min,4℃,10,000×g离心20min;
(6)弃上清,用75?滋l DEPC-H2O溶解RNA沉淀,加入7.5?滋l 2M NaAc (pH4.0),165?滋l无水乙醇,-20℃沉淀30min,4℃,10,000×g离心20min;
(7)弃上清,加入75%乙醇(-20℃)1ml,不要混合,4℃,7500×g 离心10min;
(8)弃上清,室温自然干燥RNA沉淀 (注意:RNA沉淀不能过分干燥,否则将无法使其溶解);
(9) 用DEPC-H2O溶解RNA备用。若长期保存,应将RNA悬于75%乙醇中置-20℃。
【注意事项】
1.所有试剂均用DEPC-H2O配制;操作中要防止RNA酶的污染,必须戴手套,戴口罩,玻璃器皿可在烤箱中180℃烘烤2h,灭活RNA酶,或者用新的。
2.Trizol试剂法:原理、试剂、器材.
用Trizol试剂(美国Gibco公司产品)在室温下可提取RNA、DNA及蛋白质,具有快速方便、提取量大等优点。
【实验方法与步骤】
(1)0.5~1×107 细胞或相当量的组织,用1ml Trizol试剂裂解细胞,摇动混合后室温孵育5~10min;
(2)加入2氯仿,震荡混匀15秒,置室温2~3min;
(3)10,000×g,4℃离心15min,将水相移至另一离心管中,加入 0.5ml异丙醇,混合后室温沉淀10min,10000×g离心10min;
(4)弃上清,加入1ml 75%乙醇,不混合,7500×g离心10min;
(5)弃上清,室温下空气蒸发残存的乙醇。
3.Oligo(dT)纤维素层析法提取mRNA
【实验原理】
真核细胞的3’端有poly(A)尾,因此可用Oligo(dT)纤维素结合 mRNA,从而将mRNA从总RNA中分离出来。Oligo(dT)纤维素就是将Oligo(dT)15~18结合到纤维素上,制备成能特异性结合带 Poly(A)尾RNA的纤维素。