甲胎蛋白（AFP）是目前临床应用最广泛的肝癌辅助诊断血清标志物。但是早期肝癌AFP的检出率只有30%-40%，而且在肝脏良性疾病，特别是肝癌高危人群，如慢性肝炎、肝硬化中也有部分患者会出现AFP升高。其较低的特异性，对AFP轻度升高的肝癌和慢性肝病的鉴别诊断造成较大困难。
AFP又分成三种类型：
AFP-L1主要来源于良性肝细胞；
AFP-L2多数由卵黄囊肿瘤产生，来源于孕妇；
AFP-L3主要来源于癌变肝细胞。
AFP-L3对肝癌是高特异性的指标，特异性可达到95%以上，也是诊断肝癌特异性最强的肿瘤标记物。而血清中AFP-L3占总AFP的比率，简称甲胎蛋白异质体比率（AFP-L3%）。
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