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CASMS分论坛:早期药物发现中的质谱分析

2021.8.12
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  分析测试百科网讯 美国东部时间2021年8月9日-13日,首届美国华人质谱学会(CASMS)学术研讨会暨展览会在Gather.Town隆重举行。8月10日的“Mass Spectrometry in Early Drug Discovery(早期药物发现中的质谱分析)”分论坛由百时美施贵宝研发中心科学总监Wilson Shou博士主持。来自辉瑞制药的Hui Zhang博士、先灵葆雅/默克的Jane Wen博士、强生旗下杨森制药的Juncai Meng博士、百时美施贵宝的Jun Zhang博士、艾伯维生物研究中心的Yu Tian博士、清华大学邓海腾教授分别做精彩报告。分析测试百科网作为大会支持媒体,为您带来全程跟踪报道。

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主持人:百时美施贵宝研发中心科学总监Wilson Shou博士

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辉瑞药物发现部副研究员 Hui Zhang博士

报告题目:AEMS:Brief History and Future Perspective of the Applications in Drug Discovery

  Hui Zhang博士首先介绍了当前基于LC-MS的高通量质谱(HT-MS)平台,一般10秒-30秒分析一个样本,完成一个384孔板的分析需数小时。2015年,张博士最早研发了声学雾化离子化技术,后于2016年开发ADE-OPP结合的接口,并于2020年同SCIEX合作实现声波激发与质谱耦合系统(AEMS)的商品化。当前,AEMS具有3-8%的CV重现性和2Hz基峰分离速度非常理想,兼容1536孔板,灵敏度高几乎无交叉污染,具有理想的定量线性范围,并可覆盖如mAb等广泛的化合物,且有较强的基质耐受性。

张博士随后列举实例,比如在CYP P450代谢分析中,AEMS定量的灵敏度与LC-MS类似,而且样品消耗量大幅降低,只需12分钟完成384孔板中样品的分析。

  在尿样中生物标志物的分析中,18个样品分析耗时不到1分钟,并消除了很多干扰。在体内(In Situ)动力学分析应用的结果更令人振奋,无需样品制备,是进行生物分析方法开发的好工具。总体来看,AEMS方法的优点包括:无需标记,比LC-MS方法快10-50倍;报告演示了ADME、HTS、化学、代谢动力学,生物标志物分析方面的应用潜力;AEMS对新药开发是一种有力的工具,包括快速、样品消耗量少,高通量,巨量的成本节省等。最后,张博士简介了几项新工作:开发新的DDI之上的ADME筛选法;开发结合高分辨质谱(HRMS)的方法。

 

先灵葆雅/默克 高通量筛选部门科学家 Jane Wen博士

报告题目:Observations from Our First Lap Around the Block: Successful Execution of An HTS Campaign on An Automated Echo MS

  Jane Wen博士首先介绍了质谱技术在高通量分析中的优点。Merck实验室原来筛选25万的化合物库,用Transcend-MS筛选80万化合物需时8周和2台仪器;用RapidFire-MS筛选10万化合物需时2周和2台仪器。报告主要演示和讨论了用Echo MS筛选25万化合物的结果。

  Wen博士介绍了ECHO MS的原理和操作,它分析1个样品只需1秒,样品耗量少,所需硬件维护少,并缩短方法开发时间。2019年,实验室用早期的AED-OPI-MS,筛选6400个化合物,后来用Echo MS开展了实验和验证,最后的结论是:使用ECHO MS可进行高通量高性能的生物分析,12天完成207*1536板(即30多万)上样品的筛选。从试验中,Jane建议使用分析物和ISTD内标比可获得更高的精度,没有明显的离子抑制;典型CV值,ISTD峰面积<8%;triazine标样混合物峰面积<10%。

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杨森制药首席科学家,Juncai Meng博士

报告题目:Leveraging HTMS to Accelerate Small Molecule Lead Discovery

  Meng博士首先介绍了高通量质谱平台用于药物筛选具有的诸多优点,如无标记技术,无荧光干扰,更高的灵敏度和选择性,提供更多生物学有意义的数据。接下来介绍亲和选择性质谱技术(ASMS),它为传统的高通量筛选技术提供有益的补充,是筛选富有挑战性的目标物的有效工具,并可鉴定具有多样MOA(效用机理)的目标物。Meng博士介绍并比较了三种亲和排序的策略。

 

Bristol-Myers Squibb 百时美施贵宝Jun Zhang博士

报告题目:Application of Microflow LC-MS/MS for Quantitative Discovery Bioanalysis

  Zhang博士首先介绍了LC-MS/MS生物分析用于药物发现的特点,比如常用三重四极杆质谱做SRM/MRM定量,高通量,高样品容量,快速,满足质量/灵敏度等分析目标,较短的仪器闲置时间等;但其仍面临灵敏度的挑战,用微流(microflow)的LC-MS/MS可解决这些问题。Zhang博士随后介绍了典型的操控模式,获得的结果,在蛋白结合方法(Protein Binding Assay)中的优势等。总体来看microflow LC-MS/MS对于小分子和多肽都提高了灵敏度,获得稳定和理想的分析性能;并能更好解决生物分析方法开发中的问题;而且,使用者可以很容易地在常规流速LC和微流LC间切换质谱接口,使一台质谱仪器可成功地操控在两种流速模式下。

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Abbvie(艾伯维)生物研究中心DMPK部门组学技术总监,Yu Tian博士

报告题目:Evaluation of DIA and DDA Quantitative Proteomics Strategy in Large-cohort Biomarker Discovery Applications

  Tian博士此项研究由Abbvie和UB(水牛城大学)的Jun Qu合作,分别介绍了:大型队列蛋白质组学分析中的无标记定量(Label-free),AbbVie使用的SWATH(DIA)平台,UB使用的IonStar(DDA)平台,并比较了IonStar和SWATH在蛋白质组学定量方面的性能。在制药/临床蛋白质组中,大队列的分析能力非常重要,大队列定量蛋白质组学的挑战包括:同位素标记技术费时费钱,会增加额外的馏分收集步骤,会有批量效应(batch effect);但Lable-free方法也存在挑战,比如重现性、精密度、准确度、丢失数据、假阳性率高等。通过实验比较AbbVie使用的SWATH(DIA)平台,UB使用的IonStar(DDA)平台说明,两者对75%的高丰度蛋白都展现良好性能;对大队列分析的较低丰度蛋白,UHR-IonStar具有高准确度、高精度和高重现性,但对色谱的校准(alignment)要求较高。Spectronaut结合TripleTOF方法在优化后,可定量>6000个蛋白并具有优秀的重现性,证明SWATH平台非常适用于研究非常大批量的样本,在样本分析和数据分析方面SWATH也具有更高的通量。研究者可根据不同的科学问题、样品类型、样本量等来选择不同的Lable-free定量策略。

 

清华大学生命科学学院,邓海腾教授

报告题目:Deciphering the Complexity of Aging by Redox Proteomics

  在中国老年人口比例逐年上升,更受关注的是高龄老年人的失能、失智、共病(患有一种以上疾病)等衰老问题。邓教授介绍了课题组用Geroscience来研究衰老问题。过去的理论认为,衰老标志主要源于氧化还原适应性内稳态和蛋白质稳态下降。课题组主要研究:衰老的生物标志物是什么?衰老和慢性病之间有因果关系吗?如何延长健康期?

  在用多组学研究生物标志物方面,可使用第一代蛋白/多肽测序技术、第二代串联质谱技术、第三代自上而下的质谱技术,第四代纳米孔技术等。邓教授举例了肾脏衰老的组学研究,使用基于TMT的定量LC-MS/MS技术,发现老龄Peroxisomal(过氧化物酶体)蛋白下调,使用Western-blot可发现老龄Glutathioylation(谷胱甘肽化)提高,发现肾脏衰老的27个标志物panel和代谢的途径。接下来,研究NAD+(烟酰胺腺嘌呤二核苷酸)降低在衰老和相关疾病产生关联,近期很多报道谈到抗衰老药NAD+,NMN药物等。邓教授在肾脏衰老研究中也对比了NAD+水平和使用NMN后的作用。此外,课题组还研究了同许多疾病相关的全身炎症问题,研究了其代谢途径,比如15-PGDH(15-羟基前列腺素脱氢酶)、Nrf2在衰老和肿瘤中的复杂作用。接下来介绍了活性分子靶点蛋白的鉴定,包括研究其靶标、副作用、安全性等。一个不成熟的想法是:如果人真的要“返老还童”,需要体内适应性内稳态的氧化还原/免疫/pH值都重归正常化。


关于本分论坛各演讲人的介绍,请见:http://www.casms.org/?action=content&id=49 


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