果胶类物质与细胞壁半纤维素等有共价键结合，并与其它细胞壁多聚体通过次级键结合。多价阳离子，尤其是钙离子存在时，因阳离子键合的结果，引起低酯果胶类物质的不溶性和降低高酯果胶的浸胀性。另外，纤维状果胶类物质大分子间以及其它多聚体之间，存在着复杂的机械性牵绊，也影响果胶类物质的溶解性。所以，单用酸法不能完全解除果皮中多价阳离子及其它杂质对果胶的束缚或牵绊。同时，由于果皮中多价金属离子、低分子物质和色素等果胶以外的种种物质经酸法处理后仍留于果胶中，这些不纯物给果胶的品质带来不良影响，表现在果胶的胶凝度不强、灰分含量高、果胶色泽较差。
因此，果胶提取时，采用酸水解同时结合离子交换树脂的方法。首先，酸可使原果胶溶解，由于酸水解纤维素，果胶多糖复合物，或者由于酸使水不溶性大分子降解，果皮中多价阳离子溶出，阳离子交换树脂通过吸附阳离子，从而加速原果胶的溶解，提高果胶的质量和得率。阳离子交换树脂可以吸附分子量为500以下的低分子物质，解除果胶的一些机械性牵绊，因而也可提高果胶的质量和得率。
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