因为NGU发病缓慢，症状轻，不容易受到重视。引起非淋菌性尿道炎的病原体可持续存在数月之久，且治疗需要较长时间。未正规用药后有并发症者，可长期带菌。性交时不用安全套，也造成了非淋菌尿道炎的不断扩大流行。
1.性接触传染通过NGU患者或携带者性接触而致传染。成人男性以尿道，女性以宫颈为感染部位。泌尿生殖道支原体的感染率随着性伴数的增加而增加，超过6个性伴的男子,48％有解脉支原体感染；性生活混乱的女性，其阴道分泌物中支原体的检出率亦很高。
2.产道传染新生儿可在分娩过程中由母亲产道感染，可引起新生儿肺炎、结膜炎和女婴阴道炎。
3.间接传染通过患者的衣物、用具或未经严格消毒的妇产科器械而间接接触传染。
4.自体传染通过手或污染物可使病原体从生殖器接触传染到眼睛或咽喉等处。
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