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美国华人质谱会第4天,港澳专家分享组学研究进展

2022.10.21
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TBiotin

whisper of insanity

美国东部时间2022年10月20日,第二届美国华人质谱学会(CASMS)学术研讨会暨展览会在Gather Town继续第四天的进程。本届会议以“Advancing Biological and Pharmaceutical Mass Spectrometry”(推动质谱在生物与药物领域的技术应用发展)为主题,共邀请超过60位来自美国、加拿大、中国、荷兰以及新加坡等国家的科研学界以及工业界的杰出研究人员带来精彩演讲。分析测试百科网作为会议支持媒体全程为您报导。

HKSMS特别研讨会

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报告题目:Peptides, proteins and proteomics: Our recent studies with mass spectrometry

报告人:香港理工大学 Zhongping Yao教授

近几年大数据研究与应用成为火热的领域。Zhongping Yao教授的一个工作内容是利用MS/MS得到多肽的数据并结合大数据处理、储存、检索,将多肽的氨基酸序列和具体数据信息建立关联。除此之外,Zhongping Yao还关注beta-内酰胺酶与抑制蛋白(BLIP)的相互作用机制。

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报告题目:Detect RNA-Protein Interactions in Living Cells Using CRISPR-Assisted Proximity Ligation

报告人:香港城市大学 Liang Zhang副教授

蛋白组学用于了解细胞间信号传导,这有利于进一步了解人类健康与疾病中信号传导,以便更好的指导药物治疗或者预防防控。Liang Zhang团队关注于RNA结合蛋白与lncRNA(长非编码RNA),因为lncRNA与蛋白质会发生复杂的相互作用。CRISPR辅助系统CARPID可以系统地监测天让你抱状态下lncRNA结合蛋白质组;CARPID可能会在未来与其他互补技术集成,以充分调查RBP-lncRNA相互作用。

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报告题目:Blood Biomarker Discovery by MS-based Untargeted Metabolomics Profiling

报告人:澳门大学健康科学学院精准医学研究与培训中心、转化医学研究所Terence Chuen Wai Poon副教授

基因组学、蛋白质组学和代谢组学的发展使生物标志物的发现更有迹可循。特别地,代谢组学是可靠鉴别人类疾病血液生物标志物发现的策略。Chuen Wai Poon团队发现在使用非靶向代谢组学分析生物标志物发现,高达88%的“具有统计学意义的差异代谢组特征“可能存在误差;而在评估GFR(肾功能)的生物标记物中,单个患者获得的60%差异代谢物可能存在假生物标记。

专题报告:制药和生物技术中的蛋白组学和多组学

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报告题目:Discovery proteomics/chemoproteomics to elucidate cellular drug action

报告人:默沙东研究实验室化学生物学蛋白质组学高级主任 An Chi

化学蛋白组学研究者一直致力于寻找目标物ID和配体端ID,以寻找人类致病生物学中的生物标记物。MOA(行为机制)细胞蛋白质组学研究及药物功能作用利用无标签或TMT标签或是DIA,以开发自动化的样品制备,形成有效的数据集成与分析解决方案。在蛋白组学和化学蛋白组学的协同帮助下,研究者可以基于疾病表型和生理表型发现靶向药物,并且帮助人们疾病生物学/信息学、转录组学计算机成像方面有更深入的了解。

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报告题目:Multi-omics integration – strategies, patterns and platforms

报告人:麦吉尔大学寄生虫学研究所副教授兼加拿大研究主席 Jianguo Xia

高通量技术是蛋白组学和其他组学研究的基石,而组学的数据信息也是构建目标分子和系统生物学的桥梁。Jianguo Xia介绍了借助大数据分析分析LC-MS代谢组学数据,从而研究微生物和宿主间的相互作用,了解生物衰老和癌变的原因。

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报告题目:Spatial multi-omics for disease mechanism investigation and target discovery

报告人:艾博维(AbbVie)生物研究中心组学技术总监 Yu Tian博士

组学技术与空间多组学可以给予生物技术新的观察视角,有助于帮助细胞组织成像、生物病理学及表象学等领域进一步发展。Yu Tian介绍了激光捕获显微切割和Visium是用于空间分辨蛋白组学平台的重要技术,并介绍了其在纤维化相关疾病中的案例。通过Visium和LC-MS技术的互补,空间多组学可以在空间分辨率、覆盖范围、通量和数据质量等方面取得快速进步,并与生物学信息的整合使得空间多组学在未来能有更深远的影响。

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报告题目:Exploring proteomic landscape in human disease and upon chemical perturbations

报告人:圣路易斯大学蛋白质组学与代谢组学中心族人/裘德儿童研究医院 Jumin Peng教授

Jumin Peng介绍了其团队基于MS的蛋白组学和带血组学技术;借助蛋白质ID和PTM、PPI、代谢物分子结构等鉴定表征手段;并通过无标签、SILAC、iTRAQ/TMT等方法量化,研究了泛素(Ub代码)、神经疾病(如阿尔茨海默症)和癌症领域。

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报告题目:Highly effective identification of drug target at proteome level by pH-dependent protein Precipitation

报告人:中国科学院大连化学物理研究所 Mingliang Ye教授

沙利度胺曾作为镇定剂光反应用于孕妇中,但是其致畸作用使得无数家庭深陷痛苦,且至今作用机制仍未被查明。Mingliang Ye团队提出一个新的基于能量学的方法,pH依赖性蛋白沉淀(pHDPP)以探讨配诱导的蛋白质稳定性唯一的全蛋白组药物靶点鉴定。Ye认为pHDPP是构建靶蛋白空间以揭示蛋白空间已接受药物作用机制的有力工具,在药物发现研究中有广阔前景。

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报告题目:Integrated Proteomics and Metabolomics of Mitochondrial Neurodegenerative Disease MELAS using Patient-derived Fibroblasts

报告人:乔治华盛顿大学 Haorong Li

神经退行性疾病是一种因神经元结构、功能逐渐丧失而导致功能性障碍的一类疾病。Haorong Li所在的研究团队关注神经退行性疾病中线粒体功能障碍(MELAS)。通过综合DDA和DIA多组学研究了氧化磷复合物、生物能量途径和精氨酸生物合成等过程;并发现缺乏ASS1酶阻碍瓜氨酸到精氨酸的转化,或是导致MELAS卒中样发作的原因。

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