根据英国咨询公司PGEconomics最近的数据分析，1996到2010年间，与转基因作物相关的农药使用量下降了9%。这段时期内，全球杀菌剂和杀虫剂的使用量下降了43.8万吨。预计未来几年仍将保持下降态势。
其中，抗虫棉花和耐除草剂玉米品种农药用量的减少占了大头，各自减少达17万吨。棉花杀虫剂用量的降低使得环境所受影响减少26%，而玉米除草剂相关贡献在11.5%。玉米杀虫剂用量减少了4.3万吨，对环境的影响相应降低将近38%。
大豆作为最广泛种植的转基因作物，1996至2010年期间，除草剂用量下降了1.4%，计2.88万吨，对环境影响降低了16.2%。2010年，转基因大豆除草剂用量突升7.7%，但对环境影响仍减少18%。
除草剂用量突然回升是由于部分地区的草甘膦抗性杂草的滋生，需要使用非草甘膦除草剂防控。然而，与传统作物生产相比，仅使用除草剂带来的环境影响仍然有所改善。
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