解脲支原体菌落的大小直径仅有15～25um,可通过滤菌器，常给细胞培养工作带来污染的麻烦。无细胞壁，不能维持固定的形态而呈现多形性。革兰氏染色不易着色，故常用Giemsa染色法将其染成淡紫色。细胞膜中胆固醇含量较多，约占36%，对保持细胞膜的完整性具有一定作用。凡能作用于胆固醇的物质（如二性霉素B、含PHMB成分的洁阴洗液等）均可引起解脲支原体膜的破坏而使解脲支原体死亡。 解脲支原体基因组为一环状以双链DNA，分子量小（仅有大肠杆菌的五分之一），合成与代谢很有限。 是发现的最小、最简单的具有自我繁殖能力的原核生物，其基因组也是原核生物中最小的。
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