1.发绀型先天性心脏病
如法洛四联症，完全性肺静脉畸形引流，肺动静脉瘤，亚急性细菌性心内膜炎、感染性心肌炎、风湿性心脏病、慢性充血性心力衰竭、心包炎等。
2.呼吸系统疾病
如支气管肺癌、支气管扩张、慢性肺脓肿、脓胸、肺气肿、肺结核、肠结核、特发性肺纤维化等。在肺部疾病中，杵状指最常见于肺部肿瘤和慢性脓毒性疾病、肺内分流也可引起杵状指。
3.消化系统疾病
如吸收不良综合征、克罗恩病、慢性溃疡性结肠炎、肠结核、慢性细菌性痢疾、阿米巴痢疾、蛔虫感染、结肠多发性息肉等。
4.其他
可见于特发性骨关节病、脊髓空洞症、先天性梅毒，某些中毒如砷、磷、酒精等。
5.营养障碍性疾病
可见于肝硬化。
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