肌内注射甲氧西林0.5g，半小时血药浓度达峰值，为16.7μg/ml。剂量加倍，血药浓度亦倍增。该品耐酸稳定，口服后吸收良好，30～33%可在肠道吸收；空腹口服该品1g，血药峰浓度于0.5～l小时到达，为11.7μg/ml。食物可影响该品在胃肠道的吸收。3小时内静脉滴注甲氧西林钠250mg，滴注结束时的平均血浆浓度为9.7μg/ml，2小时后0.16μg/ml。新生儿肌注该品20mg/kg后，8～15天和20～21天新生儿血药峰浓度(平均）分别为51.5和47.0μg/ml。甲氧西林在肝、肾、肠、脾、胸腔积液和关节腔液均可达有效治疗浓度，腹水中浓度低，痰中的浓度为0.3～14.5μg/g（平均为2.1μg/g）。该品难以透过正常血脑屏障。蛋白结合率很高，约93%。正常健康人T1/2为0.5～0.7小时；8～15天和20～21天新生儿的T1/2分别为1.6和1.2天。该品约49%（500mg）由肝脏代谢，通过肾小球滤过和肾小管分泌，自肾脏排出体外。肌内注射和口服给药在尿中排出量分别为40%和23～30%，10～23%尿中排出的药物为代谢产物。囊肿性纤维化病人的肾小管分泌功能增强，其清除双氯西林的速率较正常人快3倍，因此其血药浓度相当低。以甲氧西林等异恶唑组青霉素治疗此种病人时，剂量应加大，而且需监测血药浓度。甲氧西林可经胆汁排泄，该品的胆汁排泄量较其他异恶唑组青霉素者为多。血液透析和腹膜透析皆不能消除甲氧西林。