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胃肠道间质瘤其临床表现多样，其大小也存在较大差异。因其非特异的临床表现，给胃肠道间质瘤的诊断带来困难。胃间质瘤的发现可能因消化道症状经内镜检出，但其诊断与分期基本依靠CT检查。GIST影像学表现多样，主要影像学诊断要点包括肿瘤与肠壁的关系，即生产方式，强化特点及其他图像特征，比如钙化、坏死等。GIST生长方式包括腔外型、腔内型、内生型及混合型。较大肿瘤其内可伴坏死、液化，强化方式以明显不均匀强化居多。不同的生长方式，导致肿瘤与周围组织关系不同，尤其是外生性、混合型病变，极易导致影像学误诊。
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