对氟西汀或其任何一种成份过敏的患者禁用。
单胺氧化酶抑制剂(MAOI)：有报道在接受选择性5-羟色胺再摄取抑制剂(SSRI)治疗的患者同时合并单胺氧化酶抑制剂（MAOI），以及近期终止SSRI治疗转而开始MAOI治疗的患者中出现严重的、有时甚至是致命的反应。氟西汀的治疗必须在不可逆的MA O I停药2周之后，可逆的MAOI-A停药后的第二天开始。
有些病例表现出类似血液中五羟色胺综合症(类似神经阻滞剂恶性综合症的特点)。赛庚啶或丹曲林可能会对此类病人有用。合用MAOI的患者出现的反应包括：高热、僵硬、肌阵挛、植物神经系统不稳定伴有生命体征的迅速波动、以及精神状态的变化，包括极度的激越，可能发展为谵妄和昏迷。
因此，氟西汀不能与非选择性的MAOI同时使用，同样地，至少应当在停止服用氟西汀5周之后方可开始单胺氧化酶抑制剂治疗。如果是长期服用氟西汀和/或服用剂量较高时，可能需要间隔更长的时间。
不推荐氟西汀与可逆的MAOI（例如，吗氯贝胺）合并使用。氟西汀的治疗可以在可逆的MAOI停药后第二天开始。
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