不管是在药物研发还是基础科研中,检测蛋白与小分子的相互作用都是一类重要的实验。小分子最主要的特点是分子量较小,一般在1000 Da以下;并且结构性质各异,部分溶解度较差,需要使用有机溶剂(例如DMSO等)促溶;这些特点给相互作用的检测带来很大的挑战。
基于SPR(表面等离子体共振)原理的Biacore系统具有灵敏度高、可进行溶剂校正等优势,不仅可以检测较低的信号,且对分子量差异悬殊的互作类型也能精确检测,同时还能消除有机溶剂带来的影响,因此越来越多的研究者选择Biacore进行蛋白与小分子相互作用检测。
接下来,我们将根据智荟专线收集到的客户反馈,整理出了Biacore系统检测蛋白与小分子相互作用实验中常出现的代表性问题,
一
配体的固定策略以及芯片的选择
1. 是选择固定蛋白还是固定小分子?
2. 固定蛋白是选择直接偶联还是捕获法?
3. 氨基偶联蛋白配体是选择CM5芯片还是CM7芯片?
二
样品准备的相关问题
1. 如何选择运行缓冲液?
2. 需要准备多少的蛋白用来偶联?
3. 小分子分析物的浓度范围如何确定?
三
关于溶剂校正的问题
1. 什么情况下需要进行溶剂校正?
2. 如何进行溶剂校正?
3. 如何判断溶剂校正的结果是否正常?
四
结果分析中的相关问题
1. 应该选择哪种拟合模式?
2. 如何判断拟合结果的好坏?
3. 关于非特异性吸附的问题如何解决
具体详细内容,
Biacore检测蛋白与小分子相互作用的常见问题(上)
Biacore检测蛋白与小分子相互作用的常见问题(下)
一个成功的Biacore实验需要在实验设计、样品准备以及结果分析等各阶段进行问题的排查与调整,检测蛋白与小分子互作的实验中可能会出现形形色色的问题,造成这些问题的主要原因应该都在上述两篇内容中和大家讨论分享了,很多情况下未知的现象往往是已知的原因导致的。
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