多年来，Bruker一直与Matthias Mann教授的实验室深度合作，开发timsTOF Pro蛋白质组学技术。最近，他们与Zuerich ETH的Ruedi Aebersald教授、Ben Collins博士以及多伦多大学的Hannes Roest教授合作，共同研发timsTOF Pro上的最新的DIA技术，称为DIA-PASEF。
采用DIA-PASEF技术，不仅大幅提高数据利用率、减少缺失值，而且4D数据的匹配有效降低了假阳性，定量准确性更高、重复性更好，极大地提高了定量分析的可信度，适合于大样本量的定量蛋白质组研究。
DIA-PASEF扫描模式下，有效分离共洗脱肽段，通过质荷比、淌度窗口的隔离筛选母离子。（MatthiasMann教授和Florian Meier博士供图）
高质量谱图库：timsTOF Pro采用双TIMS结构，其独特的时间、空间聚焦优势，促进了灵敏度和数据采集速度的同时提升，并具有更好的谱图归属性，有利于建立更深更好的谱图库。
准确、可重复的CCS值测定：捕集型离子淌度分离提供了精确和高度可重复的碰撞截面（CCS）值，允许在数据处理和软件分析时进行淌度维度的校准和匹配。
4D数据的采集和匹配：独特的4D nanoLC-TIMS-MS分析功能，赋予了DIA-PASEF 4D数据采集和匹配能力。对比传统DIA技术，新增维度--离子淌度信息的匹配，有效降低了数据匹配的假阳性，定量结果更准确可靠。
分析软件：新的DIA-PASEF方法与OpenSwath分析软件相结合，提供了新一代的DIA方法，支持4D谱图库的建立和数据匹配分析，具有深度的蛋白质覆盖率，并具有良好的定量性能。
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