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如何在高通量组学时代乘风破浪

沃特世
2020.6.18

随着组学技术在各个领域的不断发展,人们对于大样本量的检测需求越来越高,尤其是在临床前研究以及人类健康疾病研究领域。可以说,现在已经开启了全新的高通量组学时代。

目前的液质联用方法,分析时间通常在10-20 min,当分析样本量大于1000时,分析时间则需要数周的时间。一方面,对于实验室的仪器使用及人员配置造成极大的压力;另一方面,长时间的数据采集或者多批次进样,会因为天与天之间离子响应的差异,而导致数据分析的失误。

虽然目前有研究者开发了直接注射分析法(时长通常在1-2 min),缩短了分析时间,但是由于缺少了色谱分离,会存在离子抑制,化合物信息丢失,以及同分异构体难以分析等问题。

因此,如何紧跟高通量组学的浪潮,开发适合该浪潮的方法也就迫在眉睫。

沃特世在高通量代谢组学领域一直不断探索。早在2016年,沃特世与“代谢组学之父“Jeremy K. Nicholson合作利用反相色谱-质谱联用仪开发了RAMMP(Rapid Microbore Metabolic Profiling)代谢组学高通量方法,在2.5 min内即可完成一个样品的分析。与传统液质联用技术相比,极大地提高了分析通量。

现在,沃特世利用离子淌度技术,开发出能进一步提高代谢组学分析效果的HILIC-IMS-MS高通量方法。该方法在保证高质量数据结果的同时,与传统方法相比,分析时间可缩减为原先的25%,溶剂使用量节省75%,样品消耗量仅为原先的5.6%,非常适用于组学珍贵样本的大规模高通量检测。并且由于该方法采用HILIC技术,可以对极性代谢物进行很好的分析,因此可以与之前的RP-RAMMP方法互补,实现对不同极性代谢物的高通量完整覆盖。该方法因为极高的年度下载量,已获得了2020 Metabolomics Publications Award代谢组学出版物大奖。

下面,小编就来带大家详解这一方法,是如何实现高通量组学工作的。

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首先,该方法利用沃特世小粒径BEH Amide(1.0×50 mm)色谱柱,建立了仅需3.3 min的快速分析梯度。而传统方法采用2.1×150 mm色谱柱,则需要将近4倍的时间。如下图,以sulfadimethoxine、sulfaguanidine、leucine enkephalin的QC混标为例,可见新方法分析时间大幅缩短。在分析实际生物样品时,新方法分析134个样品仅需7 h,而传统方法则需要大约1天的时间。

传统方法(a)与新方法(b)对于分析不同化合物(1)sulfadimethoxine、(2)sulfaguanidine、(3)leucine enkephalin的XIC图

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同时,该方法具有良好的重现性。如下图所示,17个大鼠尿液QC样品(分布于134个样品不同位置)中不同化合物保留时间、峰面积、峰对称性等重复性良好。

大鼠尿液QC样品TIC叠加,重复性良好

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为了进一步提升方法高通量的性能,作者引入了离子淌度技术。在采用较短色谱梯度时,由于“共流出”问题,会导致部分信号的损失。离子淌度作为色谱和质谱以外的另一维分离手段,可以有效解决短梯度所带来的“共流出”问题,从而发现更多成分,并使谱图更为“干净”,便于数据解析。

如下图所示,通过2D及3D谱图,我们可以直观的观察到,离子淌度使得原先被掩盖的信号被重新“挖掘”,从而大大提升了复杂样品的信息量。通过离子淌度,我们能发现的features从3007增加到6711,提升了123%。

大鼠尿液QC样品经离子淌度分离的2D(色谱保留时间-离子淌度漂移时间)及3D(色谱保留时间-离子淌度漂移时间-离子信号强度)谱图

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新的带离子淌度方法使峰宽从6.6 s缩减至3.8 s,使得峰容量提升了82%。峰容量的提升,可以使得质谱的数据质量更好,因此在鉴定时结果也会更加准确可靠,减少假阳性的产生。

HILIC-IMS-MS 新方法与无离子淌度(No IMS)方法峰宽分布对比

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采用离子淌度可以获得CCS值,从而提升代谢物鉴定的准确性。沃特世具有CCS数据库,实测值与数据库数值相比,通常差异在5%以内,可以对化合物进行良好的确证。如下图,化合物4-hydroxy-2-quinolinecarboxlicacid,CCS实测值与Waters CCS数据库中的数值相比,仅仅相差0.32。

 

综上,我们可以看到,在进行高通量组学分析时,采用高性能色谱柱及离子淌度技术:

● 可以缩短复杂生物样品分析时间;

● 提高检测通量;

● 并提升数据质量和结果可信性。

相较于传统液质联用方法及直接注射分析方法,具有更多优势。

网络讲座

讲座主题:

高通量组学时代全面开启,如何在该浪潮下乘风破浪

主讲人:

周超博士 沃特世高级应用工程师

讲座时间:

6月30日  14:00 – 15:00

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