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【精彩回顾】现代基因组学创新培训班:多元化前沿科技助力基因组学研究

丹纳赫生命科学
2022.5.24
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丹纳赫生命科学

基因组是物种的遗传信息文库,影响并调控着生物体的生命特征。随着人类基因组测序计划的开展,人类对于不同物种的基因序列检测项目逐渐开展。紧随其后,转录组研究,蛋白组研究亦应运而生。基因组学的诞生也象征着人类对大自然以及生物界的好奇与探索。

 

2022年5月19日,丹纳赫生命科学联合旗下埃德特生物科技有限公司和贝克曼库尔特生命科学,组织了一场集理论与实践于一身的现代基因组学创新培训班。

 

借助于广州生物岛舒适的绿化环境以及临江优势,丹纳赫生命科学搭建了开放式培训教室。到场的30余名学员济济一堂,在丹纳赫生命科学粤港澳大湾区总部参加了这场培训班,四面环绕的显示屏与立体声音效设置带来了沉浸式的培训体验。



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培训开始,来自于埃德特生物科技公司的应用经理王丙寅博士,在上海为在座各位学员远程介绍基因组学的前沿与最新技术。针对目前基因组学在转化医学方面的应用转化,王博士对Gene Reading和Gene Writing这两方面进行了讲解。同时,他还介绍了时下最受关注的医学相关biomarkers,包括TMB、MSI、MRD的原理和应用意义,以及备受关注的基因编辑相关技术。


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对于现代基因组学研究来说,自动化一体化技术的面世大大促进了基因组学的发展。对比传统实验的繁琐手工操作,自动化仪器可替代绝大多数的手工操作部分,充分解放人力。来自贝克曼库尔特生命科学的市场经理陈奕奕,向学员们展示了贝克曼库尔特实验室自动化解决方案的独特魅力。



样品的核酸提取是基因组学研究的第一步,贝克曼库尔特生命科学提供常用的核酸提取相关试剂,包括FormaPure XL Total总核酸提取试剂、DNAdvance Genfind v3 DNA提取试剂、RNAdvance Cell v2 RNA提取试剂等。提取试剂以SPRI专利磁珠法核酸抽提作为核心技术,能够完整配合Biomek 4000、Biomek i5、Biomek i7自动化操作平台。


Biomek i5/i7系列实验室工作站,适配多种耗材和应用,可实现从核酸抽提到文库制备的自动化步骤,实现仅需44分钟即可完成192个样本的纯化,每个样本仅用2根吸头。搭配Echo 550声波移液系统,充分适应二代测序文库的pooling操作。全过程无需物理接触样本,无需枪头;快速移液,每秒钟可产生200-500次微滴,5分钟可移液384孔板,12分钟即可完成384个文库的pooling。真正意义上实现减少试剂使用,提高实验准确性,降低交叉污染。


基因组研究的核心技术,主要依托于二代测序的发展与应用。通过高通量测序实现快速准确的基因组序列测序,是目前科研和转化医学研究等领域的重要手段。来自埃德特生物科技有限公司的应用科学家易琛,介绍了不同类型的基因组学应用的二代建库方式,从常规的DNA建库,到甲基化建库。此外,她对验证实验常用的qPCR技术以及功能基因组学常用的基因编辑技术也做了相关讲解。



顺应基因组学的日益发展,埃德特生物科技根据不同应用场景提供不同的建库方案,包括常规的DNA建库专用的xGen DNA library建库试剂、针对精准医学研究用户提供的cfDNA和FFPE DNA微量/低质量DNA建库试剂、ssDNA与痕量DNA建库试剂等;对于转录组学的研究,提供xGen RNA & Broad-Range RNA建库试剂方案,专利Adaptase单链文库构建技术、实现链特异性的建库思路;此外Adaptase技术亦运用到甲基化检测的领域,创新的xGen Methyl-seq DNA建库试剂盒,单链DNA建库,提供完整性更高、偏好性更低的甲基化文库。埃德特生物科技也提供捕获探针xGen Custom Hyp Panel和多重PCR富集扩增建库SNAP扩增子方案,搭配Normalase文库均一化产品xGen Normalase Module,实现高效的富集建库解决方案。


qPCR作为基因组学常用工具,在基因分型检测与基因表达验证方面广泛使用。PrimeTime qPCR双淬灭探针,具有背景值低、荧光强度强的特点,有效提高检测灵敏度。Affinity Plus锁核苷酸技术,具有提高探针Tm值的功能,对错配位点具有更高辨别力,有效提高探针的特异性。


功能基因组学,主要是利用结构基因组所提供的信息和产物,通过在基因组或系统水平上全面分析基因的功能。埃德特生物科技在基因编辑方面提供相关的产品,包括从Cas9基因编辑系统相关的Alt-R Cas9 gRNA和HDR设计工具,到相关的Alt-R引导RNA、CRISPR蛋白、HDR试剂等。


随着培训达到高潮,丹纳赫生命科学应用团队带领学员们参观了丹纳赫中国生命科学研究院广州应用研发中心。通过展示与实践,让学员们充分理解自动化工作站的原理,并感受到多功能整合工作流在基因组研究应用上的高效与强大。


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全天的培训结束后,丹纳赫生命科学为每一位学员颁发了培训证书。通过综合性培训,每位学员都有所收获。丹纳赫生命科学整合旗下众多全球知名品牌的优势技术,为用户提供从核酸抽提、二代测序建库到功能基因组研究的全流程解决方案。随着我们的不断创新,将会为广大客户持续提供更有价值的技术支持,与您共享全球科技,助力本土创新。


丹纳赫中国生命科学研究院应用研发中心全年开设多场课程,主题涵盖合成生物学核心流程及技术、蛋白/代谢/脂质/基因组学先进研究技术、工程细胞株的开发、蛋白类药物的理化分析和生物活性分析、基因治疗产品的关键质量属性分析等,并且还会根据行业动向、技术发展,持续开设新课程,以满足不同用户的需求。感兴趣的伙伴们,可以点击“阅读原文”报名参与!


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