【一些概念】关于启动子

 转录单元（transcription unit)

转录单元（transcription unit) 是一段从启动子（promoter）开始至终止子（terminator）结束的DNA序列。RNA聚合酶从转录起点开始沿着模板前进，直到终止子为止，转录出一条RNA链。在细胞中，一个转录单元可以是一个基因，也可以是几个基因。

转录起点

转录起点是指与新生RNA链第一个核苷酸相对应DNA链上的碱基，研究证实通常为一个嘌呤。常把起点前面，即5’末端的序列称为上游（upstream），而把其后即3’末端的序列称为下游（downstream）。在描述碱基的位置时，一般用数字表示，起点为+1，下游方向依次为+2、+3……，上游方向依次为-1、-2、-3……。

启动子定义

在遗传学中，启动子是指一段能使特定RNA转录本进行转录的DNA序列，RNA转录本包括编码蛋白的mRNA，或者是tRNA，rRNA。启动子的结构影响了它与RNA聚合酶结合的亲和力，从而影响了转录水平。

启动子位置

启动子位于控制基因表达的调控序列中、基因转录起始位点的上游（朝向DNA正义链的5′方向），长约100~1000个碱基对。启动子序列中的DNA顺式作用元件序列，为RNA聚合酶和转录因子提供了一个稳定的结合位点。转录因子是一种招募RNA聚合酶并控制和调控RNA转录的蛋白质（一些概念：转录因子）。

启动子位置示意图

启动子结构

启动子主要由三个部分组成:核心启动子、近端启动子和远端启动子，以下以真核启动子为例介绍。

核心启动子——引发转录的必要部分及转录起始点。位于最靠近起始密码子的位置大约-35 bp，包含RNA聚合酶结合位点、TATA box和转录起始位点(TSS)，一般转录因子蛋白和组蛋白可以在该区域结合。核心启动子区域也含有其他元件，但是未发现类似“通用元件”的序列存在。

近端启动子——基因的近端上游序列，包括一些基本的调控元件。位于起始位点上游大约250 bp，是特异转录因子结合位点集中区域。

远端启动子——是基因的远端上游序列，包括一些额外的调控元件，一般影响力较近端启动子弱。它是在上游更远的位置（但非增强子或其他调控区域），存在特定转录因子结合位点。

真核转录

真核启动子一般比原核启动子复杂多样得多，跨域的DNA序列范围广。能够与其他调控区域(增强子、沉默子、边界元件/绝缘体)协同工作，指导RNA转录本的转录水平。

真核转录示意图

启动子研究方法

转录单元（transcription unit) 是一段从启动子（promoter）开始至终止子（terminator）结束的DNA序列，RNA聚合酶从转录起点开始沿着模板前进，直到终止子为止，转录出一条RNA链。在细胞中，一个转录单元可以是一个基因，也可以是几个基因。