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轻松搞定26色免疫分型分析—NovoCyte Penteon新应用

安捷伦细胞分析
2022.10.25

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点击图片,26色实验全程尽在掌握    


26色免疫分型panel是为安捷伦NovoCyte Penteon流式细胞仪设计和优化的,用来鉴定和表征健康C57BL/6小鼠不同组织中的白细胞亚群。

结果应用NovoExpress软件(V1.5.6)进行二维图分析,应用FlowJo软件 (v10.8.1)进行⾼维分析(t-SNE、UMAP v3.1和FlowSOM v3.0.18)。

抗体滴定

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图1. 26色方案的抗体滴定。 所有抗体滴定七个浓度,起始浓度范围为1-4 μL抗体每100 μL染色体积,使用C57BL/6小鼠的脾细胞。最佳浓度的选择基于染色指数(即最大或接近最大染色指数的最低抗体浓度),并用红框表示。


手动圈门策略

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图 2. 小鼠脾脏免疫细胞亚群鉴定分析的手动圈门逻辑。所有白细胞亚群都可以通过手动圈门准确地区分,在一管样品中可以准确区分T 细胞、B 细胞、NK 细胞、NKT 细胞、单核细胞、巨噬细胞、DCs、嗜碱性粒细胞、嗜酸性粒细胞和中性粒细胞。


不同组织间分群对比

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图 3. 骨髓、血液、淋巴结和脾脏中免疫细胞FACS 图的比较。分析样品时使用与图2中脾细胞相同的手动画门策略。并展示了骨髓、血液、淋巴结和脾脏的主要细胞亚群的画门,以便进行直接比较。


高维分析

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图4. 高维分析。 在去除碎片和粘连细胞之后,将每个组织样本中live+CD45+门中的细胞减少到50,000个事件并合并成一个文件,然后将除了CD45和活/死染料以外的所有标记分别进行UMAP,t-SNE和FlowSOM分析。(A)UMAP、t-SNE和FlowSOM分析:(ⅰ)UMAP图。(ⅱ)UMAP与手动圈门细胞亚群的叠加。(ⅲ)UMAP与FlowSOM子集的叠加。(ⅳ)t-SNE图。(ⅴ) t-SNE与手动圈门细胞亚群的叠加。(vi) t-SNE与FlowSOM子集的叠加。(B)对live+CD45+细胞进行t-SNE分析:(ⅶ)骨髓,(ⅷ)血液,(ⅸ)淋巴结和(ⅹ)脾脏。

不同白细胞亚群在不同组
织之间的分布比例

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图5. 比较不同组织中各细胞亚群的占比。堆叠柱状图代表手动画门的CD4+ naïve、CD4+ EM 和 CD4+ CM,CD8+ naïve,CD8+ EM和CD8+ CM,B细胞,NK细胞,NKT细胞,cDCs,pDCs,单核细胞,巨噬细胞,嗜中性粒细胞,嗜酸性粒细胞和嗜碱性粒细胞的比例,如图2和图3所示。


FMO对照

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图 6.在方案检测时选择部分marker设置FMO对照。表面marker的背景染色可以通过使用 FMO 对照来验证圈门的正确性。图中显示的是完全染色样品和相对应FMO的图,并且圈门与图2中的一致,用以确认圈门是否正确。


结       论

·  26色方案可以准确区分小鼠不同组织中的白细胞亚群。

·  本实验中使用安捷伦NovoCyte Penteon流式细胞仪可以保证同时在单管中分析多达26种标记物,为检测低表达抗原提供更好的分辨率。

·  安捷伦NovoCyte Penteon流式细胞仪为研究人员提供了更多的选择,可以轻松完成高度复杂的多色流式细胞术方案,以解决他们的生物学问题。


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点击图片,可了解更多26色实验全程,如需下载,请点击“阅读原文”。


参考文献

[1] DusoswaS.A., VerhoeffJ., Garcia-Vallejo. J.J. OMIP-054: Broad Immune Phenotyping of Innate and Adaptive Leukocytes in the Brain, Spleen, and Bone Marrow of an Orthotopic Murine Glioblastoma Model by Mass Cytometry. Cytometry A. 2019 Apr;95(4):422-426.

[2] Mapping leucocyte populations in mouse lymphoid tissues and blood. Application Note.

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安捷伦科技有限公司(纽约证交所:A)是生命科学、诊断和应用化学市场领域的全球领导者,致力于为提高生活质量提供敏锐洞察和创新经验。安捷伦的仪器、软件、服务、解决方案和专家能够为客户最具挑战性的难题提供更可靠的答案。2021财年,安捷伦营业收入为63.2亿美元,全球员工数约为17,000人。

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