核酸质谱之漫话三：核酸质谱法在人乳头瘤病毒(HPV)分型检测中的应用

人乳头瘤病毒(HPV)，是一种乳头瘤空泡病毒，女性患病率通常高于男性。部分类型的HPV感染是宫颈癌的高危因素。感染后主要累及人体的皮肤和黏膜，可分为低危型和高危型。

高危致癌型HPV分布于α属第5,6,7,9,11五个种。高危型HPV感染是宫颈癌、口腔癌、直肠癌、食道癌等恶性疾病的危险因素之一。而在在女性恶性肿瘤中，宫颈癌的发病率仅次于乳腺癌，大多数宫颈癌是由HPV感染所致。已分离出的HPV达100多型，其中至少14型可导致宫颈癌或其他恶性肿瘤。全球范围内，大多数的宫颈癌中可测出高危型HPVl6和18亚型，其中HPV16亚型诱发癌变的潜力最大。

HPV基因分型检测的意义

HPV的感染在治疗前后，可能存在型别的差异，这可以作为医生治疗效果的评估指标；

连续两次HPV分型检测显示单一型别的高危亚型的感染，显示宫颈癌发生的可能性增大；

因此，HPV基因分型检测能够：

确认感染危险程度

极高危型HPV16型感染会在几年内发展为宫颈上皮内瘤变三级（CIN3）+至浸润性癌，而非致癌型HPV61的感染，持续很长时间也不会发展为癌。

确认是否持续感染

高危型持续感染是导致宫颈癌的最主要因素。大多数HPV感染在1-2年内可清除，当间隔一年以上、连续两次以上检测出同一种或组HPV基因型时，被认为是持续性感染。若第一次HPV检测结果阳性，很难确定感染的时间。从感染HPV到发生宫颈癌最少需要8-10年的潜伏时间，连续检测可以有效避免错过治疗纠正的机会。

识别传染源

人所感染的HPV与感染源的基因型相同。可以使用安全措施及共同治疗和检测进行，有助于持续性感染纠正。

疫苗接种指导

只要没有感染疫苗覆盖的类型，接种都是有益的。

目前HPV 技术检测面临的问题

L1靶标基因整合后脱落漏检

现有的技术平台，几乎所有的HPV检测产品均以L1为靶点。无法避免病毒进入细胞后从游离态变为整合态，L1基因脱落，导致恶变样本漏检。

动态范围窄，高危低载量出现漏检

以目测法和荧光法定性的检测，动态范围窄。当多基因型混合感染时，无法检出高危低载量HPV病毒，导致高危致癌型漏检。

致癌高中危型未全覆盖，造成漏检

对高危型采用致癌基因E6，极高危HPV 16/18型采用E6/L1双基因，从而避免病毒基因整合造成的假阴性，能够最大限度避免出现漏检；

高灵敏度：可扫描超过40种HPV基因型。特异性PCR扩增+探针单碱基标记，以分子量分型，灵敏度达个位拷贝，超宽动态范围超过9个数量级；

能够防交叉反应以及防扩增污染，从而有效避免假阳性；

高通量：每天可检测上千个样本。

东西分析经过多年的开发，基于飞行时间质谱技术平台成功开发出40多种HPV分型的应用方案，能够同时快速检测出超过20种高危和低危致癌及常见致疣HPV型以及超过20种可能致癌和低危致疣HPV型。能够有效避免恶变样本漏检和假阳性，从而为临床提供早期宫颈癌的精准诊断，并为治疗提供准确的参考建议。

Ebio Reader 3700 Plus飞行时间质谱仪

操作简单

无需复杂的样品前处理。

性能稳定

长寿命固体激光器；

飞行管随环境温度、湿度的变化小，保证检测的稳定 ；

高效网筛离子源，提高仪器的灵敏度 ；

PIE高压脉冲电源控制，实现离子的延迟推斥，提高整体仪器的分辨能力。 

软件智能

基于神经网络聚合分类法的人工智能软件；

拥有强大数据库，实现对菌种的实时鉴定；

具备聚类分析功能，可进行T-test等数据分析；

具有自建库功能，可根据用户实际情况建立自有菌种库 ；

可根据用户具体需求，进行相应升级，用于疾病蛋白标志物和核酸基因分型的检测。

应用范围广

广泛用于临床、疾控、食品安全、农业、工业、出入境检疫等领域。