DNA甲基化是重要的表观遗传学标记信息,在维持正常细胞功能、遗传印记、胚胎发育及人类肿瘤发生中起着重要作用。获得全基因组范围内所有甲基化位点及水平数据,对表观遗传学的时空特异性研究具有重要意义。全基因组甲基化测序(Whole Genome Bisulfite Sequencing, WGBS)技术,采用亚硫酸氢盐处理基因组DNA,使未发生甲基化的胞嘧啶(C)被转化为尿嘧啶(U),而甲基化的胞嘧啶不变。亚硫酸氢盐处理后的DNA进行全基因组测序,并与参考基因组进行比对,从基因组水平实现单碱基分辨率的、高精确度甲基化水平分析,广泛应用于细胞分化、组织发育、动植物育种及人类健康与疾病研究等领域。
技术优势
精确度高,单碱基分辨率。精确分析单碱基甲基化状态;
检测范围广,能够对全基因组范围内的甲基化区域进行研究;
可靠性高:直接对甲基化片段进行测序定量,无交叉反应和背景噪音
技术流程
应用范围 基因表达调控、肿瘤研究、染色质重塑、遗传印记、疾病研究、胚胎发育、环境与表观遗传、表观异质性等等。 分析示例
各样品甲基化水平在genome上的分布情况的IGV 展示截图 不同类型甲基化C碱基的分布比例 甲基化水平在基因和TE上的分布 甲基化水平在染色体上的分布情况 甲基化的CHG,CHH附近9bp碱基的序列特征分析 差异甲基化区域(DMRs)在染色体上的分布 差异甲基化区域(DMRs)GO富集图