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细菌感染性疾病的直接核酸诊断试验(四)

2020.7.20
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王辉

致力于为分析测试行业奉献终身

2.NAATs:Roche公司的AMPLICOR试剂是第一代基于PCR的NAAT;而BD公司的BDProbe Tec是第一代基于SDA的NAAT。这些试剂扩增的目标序列通常位于染色体DNA或质粒中。BDProbe Tec目前有两种:一是检测CT的BDProbe Tec CT,另一种是可以在一份标本中同时检测CT和GC的BDProbe Tec CT/GC。新近出现的CT/GC NAAT是Gen-Probe公司的Combo 2试剂,它是基于TMA的第二代NAAT,通过在一份标本中同时扩增CT和GC的rRNA分子而对二者进行检测和确定。这种试剂采用一种独特的目标捕获方法对目标分子进行纯化和浓缩以去除可能存在于标本内的抑制物。目标捕获方法采用特异性探针将目标rRNA分子结合到磁微粒上,未结合的分子经洗涤除去。随后已经过纯化和浓缩后的目标分子通过TMA进行扩增。

3.检测CT和GC的直接NATs的灵敏度和特异性:检测CT的NAATs通常比非扩增的NATs和CT培养的灵敏度高,而检测GC的NAATs的灵敏度与培养和非扩增的NATs相似。采用拭子标本的所有检测CT的NAATs一般都有较高的灵敏度(>90%),其中Combo 2试剂的灵敏度最高(>90%)。

对于泌尿生殖道标本,PACE 2试剂盒被批准只可采用男性尿道和女性宫颈内拭子标本检测CT和GC。而NAATs不仅可以采用拭子标本、也可使用尿液标本。由于尿的采集是非侵入性的,易于被病人接受,同时也减轻了工作负担。由于高水平抑制物质的存在,采用尿标本的第一代NAATs的灵敏度比采用拭子标本低5-10%,这点在女性更为明显。采用PCR方法(如AMPLICOR试剂)检测女性尿标本中GC的效果尚不清楚。SDA方法已获批准可以采用男性和女性尿标本进行检测,但女性尿标本检测灵敏度比宫颈内拭子标本低大约10%。Combo 2靶捕获方法可以减少抑制,因此采用该试剂检测尿标本的灵敏度高达91%-100%。

CDC最近发表了CT和GC检测指南(表4)。NAATs因其高灵敏度被推荐用于CT检测,但也可采用探针检测和EIA方法。对于GC检测应首选拭子标本培养,因其具有很高的灵敏度,并能进行药敏检测。NAATs和探针检测的灵敏度与GC培养相似,当因转送和储存条件不佳难以进行培养时推荐采用NAATs和探针检测。不论CT还是GC感染,所有检测方法均推荐采用男性尿道和女性宫颈内拭子标本。如果侵入性的拭子采集方法不被接受或不能采集,NAATs可采用尿标本。由于交叉污染或某些第一代NAATs可以和非淋病奈瑟菌发生非特异性反应,CDC建议核查一些阳性结果以排除假阳性。在低流行人群中,对CT/GC NAAT结果阳性者应进行附加NAAT检测以排除可能出现的假阳性结果,避免给患者带来不良影响。阳性结果的确认应采用不同的NAAT或采用技术相同但扩增不同CT/GC序列的NAAT,以帮助排除假阳性结果。

表4.  CDC推荐筛查男女CT和GC感染的检测方法

   病原体         检测方法

              采用拭子或尿标本的NAAT

              采用拭子标本的非扩增NAT、EIA

     衣原体(CT)   或DFA

                      拭子培养


                            拭子培养

     淋球菌(GC)     采用拭子标本的NAAT

                            或非扩增NAT

                            采用尿标本的NAAT


五、直接NATs的未来发展趋势

提升自动化程度使操作更容易是直接NATs的未来发展趋势之一。现行的直接NAT仪器大多只能自动化操作检测过程中的一部分(如扩增或测定)。新的全自动仪器如TIGRIS DTS(Gen-Probe公司)可以自动化完成所有检测步骤,每12小时最多可进行1000个测试。

一些以往采用繁杂、冗长检测方法的NAATs正开始使用测定扩增反应中产生的复制序列的探针(实时检测)。实时扩增技术尤其适用于定量检测。

多元化检测也是未来发展的一个方向,它可以用一项检测来测定多个病原体。相信扩增技术、生物芯片和微流体技术的应用最终能够使我们采用一项检测、用一份标本来检测多个不同的病原体,不仅快捷、而且具有良好的性价比。

六、结论

直接NATs代表了检测细菌感染的诊断方法上的一项突破。快捷、精确、采用标本灵活使得直接NATs在临床实验室的用量持续增长。在诸如CT感染等多种细菌感染的诊断中,直接NATs正在越来越多地替代培养和其它常规方法。在TB的诊断中,由于需要区分不同的分枝杆菌和测定药敏,所以NAATs还不能完全取代培养,但NAATs和培养可以取长补短、联合用在TB的诊断中。用于分枝杆菌的NAATs的未来发展包括检测不同分枝杆菌的多元化测定和药敏测定。更新一代的直接NATs也正在研发中。


七、参考文献(略)

作者简介:Florence Paillard, PhD,美国科学和医学专业作家;Craig S. Hill, PhD,美国Gen-Probe公司科学事物主管。


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