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蛋白质动力学的研究最直接地涉及这些状态之间的转换，但也可能涉及状态本身的性质和平衡种群。可以分别在“能源格局”范式中从概念上综合考虑这两种观点（分别是动力学和热力学）：人口稠密的状态，它们之间的跃迁动力学可以通过能量井的深度和能量垒的高度来描述。
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