1、生长激素
生长激素的缺乏是导致生长障碍的最重要原因之一。垂体本身损伤或发育不良可致分泌生长激素功能低下引起生长激素的缺乏。下丘脑本身产生的生长激素释放激素不足，垂体缺乏刺激，造成继发性垂体功能低下或垂体萎缩导致生长激素的分泌障碍也可引起生长激素的缺乏。
2、甲状腺素(T4)和三碘甲状腺原氨酸(T3)
T3 , T4的低下可致生长障碍。人体的长高主要取决于四肢长骨的生长，T3 , T4低下时，长骨的生长将延缓，各部位骨骼二次骨化中心出现时间，完全骨化以及骨干连接的时间均大大推迟，造成身材矮小。
3、性激素
青春期生长激素的释放与性激素水平密切相关，因此性激素亦可影响人体的生长发育。对青春期前或青春期后的小儿，给外源性激素，即使量很少亦可使生长激素分泌率上升，生长激素分泌量增高，且男孩身高增长加速高峰亦出现于血中睾酮近成人水平的青春发育晚期，说明性激素的水平直接关系到生长激素的分泌。
4、微量元素
微量元素对儿童的生长发育具有重要作用，是机体代谢和组织发育不可缺少的物质。小儿体内锌缺乏可能影响脑垂体中生长激素的生理作用的发挥或通过影响体内200多种与锌有关的酶的功能影响体内物质代谢而导致生长落后，低锌亦可出现T3 、T4的低下，这是由于外周组织和下丘脑一甲状腺轴的功能受低锌影响的结果，导致基础代谢减退，最终影响儿童的身高。铜的缺乏可导致骨质疏松影响生长发育，锌对铜又有拮抗性，所以必须保证体内各微量元素之间的合理比例，过高或过低都会影响正常的生长发育。
5、基因缺陷
近年来分子生物学研究表明生长激素受体基因可因部分缺失或点突变或基因转录、翻译过程中的异常而导致生长激素受体的缺乏或功能减退。Laron综合征(Laron侏儒)即为生长激素受体或生长激素受体后机制多基因缺陷的常染色体隐性遗传病，由于基因缺陷类型不同或有复合性基因缺陷可能造成除生长障碍外的一些特殊体征，如蓝色巩膜、先天性髓关节脱位、肘关节伸展受限等。
6、其他因素
某些神经介质，外周血生长激素水平，胰岛素生长因子，胰岛素生长因子结合蛋白，生长激素结合蛋白等对生长激素的分泌和代谢有反馈性调节作用，它们的异常可引起生长激素的异常。在临床上不合理的使用激素，也可导致生长发育迟缓。
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