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筛选寡核苷酸针的原则

2023.2.07
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zhaoqisun

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筛选寡核苷酸针的原则

下面是筛选寡核苷酸针的一些原则。

一.长18~50nt,较长探针杂交时间较长,合成量低;较短探针特异性会差些。

二.碱基成分:G+C含量为40%~60%,超出此范围则会增加非特异杂交。

三.探针分子内不应存在互补区,否则会出现抑制探针杂交的“发夹”状结构。

四.避免单一碱基的重复出现(不能多于4个),如-CCCCC-。

五.一旦选定某一序更符合上述标准,最好将序列与核酸库中核酸序列比较,探针序列应与含靶序列的核酸杂交,而与非靶区域的同源性不能超过70%或有连续8个或更多的碱基的同源,否则,该探针不能用。


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