微生物学检查主要是采取尿道脓性分泌物涂片，革兰氏染色镜检，如在中性粒细胞中发现革兰氏阴性双球菌时，就有诊断价值，必要时进行分离培养。对患者应早期用药，彻底治疗。
2011年10月12，英国发现淋球菌具抗药性，英国的医生们原先用于治疗淋病的抗生素药物正在变得不再有效，因为引发这种性传播疾病的病菌正在发展出抗药性。英国健康保护局（HPA）表示，即将迎来一个转折点，届时对于这种疾病将无能为力，除非出现新的疗法。在现在这一阶段，医生们必须开始停止使用之前治疗时常规使用的药物头孢克肟，转而使用两种更加强力的抗生素药物。其中一种是口服药片，另一种是注射药剂。英国健康保护局认为面对病菌已经提升的抗菌能力，采用更加强力药物的做法是必要的。
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