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单抗药物电荷异质性分析的新时代现已来临!

安捷伦视界
2019.3.15

2018 年,关于肿瘤免疫的那些事儿

6 月:国内首款 PD-1 单克隆抗体药物获批,中国跨入肿瘤免疫时代

10 月:诺贝尔生理学或医学奖授予美国科学家詹姆斯·艾利森  (James Allison)  与日本科学家本庶佑  (Tasuku Honjo) ,以表彰他们在癌症免疫治疗方面所做出的贡献

12 月:国内首款国产 PD-1 单克隆抗体药物获批,开启肿瘤免疫治疗“亲民”时代

肿瘤免疫治疗的火爆让单克隆抗体药物(下文简称单抗)的研究越来越受到关注,今天我们就来聊聊单抗的一大特性——电荷异质性。

抗体是指能与相应抗原特异结合的具有免疫活性的球蛋白,而单抗是由单一 B 细胞克隆产生的高度均一、仅针对某一特定抗原表位的抗体。同其它蛋白一样,单抗常常存在广泛的翻译后修饰和降解,如糖基化、碳端赖氨酸丢失、脱酰胺化、二硫键错配、糖化和氧化等。几乎这些所有的翻译后修饰都会直接或间接的引起单抗表面电荷的变化,这就是单抗的电荷异质性。电荷异质性影响单抗的体外及体内的活性、安全性、可行性和质量,在新药研发和生物类似药的开发中都非常重要。

电荷异质性的检测通常采用基于电荷分离的技术手段,如离子交换色谱、毛细管等电聚焦(CIEF),以及成像毛细管等电聚焦(iCIEF)等。与主峰  (Main peak)  相比,这些变异体峰通常被称为酸性峰  (Acidic variants)  和碱性峰  (Basic variants) 。大部分的人源 IgGs 具有碱性的等电点,因此,阳离子交换色谱通常被用于分离。在主峰前面的峰通常称为酸性峰,因为其带有的正电荷较少,洗脱较快;在主峰后面的峰称为碱性峰。酸碱峰的鉴定采用离线收集鉴定或多维液相-质谱联机在线鉴定。

图 1. 阳离子交换色谱分离酸碱峰示例图

毛细管等电聚焦(CIEF)是电荷异质性表征的主要手段,但采用 CIEF 分离时收集馏分用于鉴定非常困难,所以 CIEF 通常用于监控电荷异质性而不能用于表征。质谱检测虽然广泛应用于单抗的表征,但是将 CIEF 和 MS 联机一直是非常大的挑战。质谱在线检测的缺失也限制了 CIEF 在蛋白电荷异质性的表征上的应用。将 CIEF 分离的高分辨特性和质谱的表征能力结合起来是电荷异质性表征迫切需要的技术。

Agilent 7100 CE-QTOF 联机的特点

无与伦比的毛细管分离的分辨率:甘油改性剂降低非 CIEF 电泳迁移和区带展宽

两性电解质:兼顾电泳分辨率和质谱灵敏度

质谱友好的阳极液和阴极液

优化的鞘流液组成:有效的聚焦、迁移和电喷雾离子化

纳流级别的鞘流液流速:基于电渗流技术的纳流鞘流液最大限度提高检测灵敏度

优化的 CIEF 运行参数:进样量、电场强度、压力

灵敏度高、抗污染的质谱:Agilent 6200 系列 TOF,6500 系列 Q-TOF

图 2.  Agilent 7100 CE-QTOF 联机图

CIEF-MS 的方法可行性及卓越表现

采用等电点标记物(pI markers)进行验证,等电点和迁移时间之间具有良好的线性相关性  (R^2=0.99)。此外,CIEF-MS 方法采集的四种单抗的电荷变异体分离的轮廓图也通过成像毛细管等电聚焦紫外方法比对验证一致。pI markers 的绝对迁移时间的相对标准偏差小于 5%(n=4)。贝伐单抗三次进样的相对迁移时间 RSD 小于 1%,绝对迁移时间小于 2.3%,峰面积的 RSD 小于 7%。并且,单抗的电荷变异体可通过质谱直接测得其分子量。

CIEF-MS 采集的电荷变异体轮廓分布和 iCIEF-UV 检测具有高度的一致性。iCIEF-UV 通过全柱成像检测去除了等电聚焦后分析物迁移到检测器端的步骤,CIEF-MS 和 iCIEF-UV 检测结果的高度一致性证明了在线 CIEF-MS 分析单抗电荷变异体史无前例的高分辨率。除了高分辨率之外,该方法具有非常好的重现性。

CIEF-MS 电荷异质性分析的应用实例大集结

贝伐珠单抗的分析

CIEF-MS 和 iCIEF-UV 分析得到的酸碱峰比例接近,分别为酸性峰: 主峰: 碱性峰= 23% : 72% : 5% 和 27% : 68% : 5%。除了 CE 的高分离度之外,质谱数据优异的原始谱图是实验分析制胜的关键,尤其是在鉴定跟主峰质量差别很小的变异体时,如在分析一个脱酰胺  (+1Da)  质量差时,一款性能优异的质谱是 CIEF-MS 分析的必备之选。

贝伐珠单抗的主峰分子量为 149 202 Da,碱性峰 B1 和主峰之间的质量差为 +128 Da,和碳端赖氨酸 (+128 Da, +1K)  异质性匹配;碱性峰 B2 (∆=-17Da)  和氮端焦谷氨酸环化修饰  (-17Da)  匹配;酸性峰 A1 (∆= 1Da)  和脱酰胺修饰匹配。酸性峰 A1 和主峰只有 1 Da 的质量差别,虽然我们会担心质谱准确度因素带来的不确定性,但酸性峰的位置和正好 1 Da 的质量差让我们有理由相信酸性峰 A1 是脱酰胺的修饰峰。A2 峰的信号非常弱,可能是高糖基化修饰的峰。

图 3. 贝伐珠单抗 CIEF-MS 分析结果图

曲妥珠单抗的分析

曲妥珠单抗和贝伐珠单抗的电荷异质性分布的差异较大。iCIEF-UV 测得的低含量碱峰在CIEF-MS上未检出,同时其对酸峰的分离效果也优于 CIEF-MS 分离。质谱检测结果清晰的展示了酸性峰中四种主要的糖型变异体。曲妥珠单抗的主峰分子量为148 224 Da,酸性峰 A1 (∆m = +1Da) 和酸性峰 A2 (∆m = +2Da) 和脱酰胺修饰匹配,并且和 2D CZE-MS 的结果一致。

图 4. 曲妥珠单抗 CIEF-MS 分析结果图

英夫利昔单抗的分析

英夫利昔单抗的三个电荷变异体峰在 CIEF-MS 上有良好的分离。解卷积结果显示两个碱峰为碳端赖氨酸变异体,碱性峰 B1 (∆m = +258 Da) 和两个赖氨酸匹配;碱性峰 B2 (∆m = +129 Da) 和一个赖氨酸匹配;酸性峰 A (∆m = +5 Da) 小的质量偏差显示其可能为脱酰胺的修饰。

图 5. 英夫利昔单抗 CIEF-MS 分析结果图

西妥昔单抗的分析

西妥昔单抗是人鼠嵌合的 IgG-1 单抗,具有高度的微观不均一性,该特性主要源于高度复杂的糖基化修饰。西妥昔单抗重链的 Fab 和 Fc 上各有一个糖基化位点,同时有碳端赖氨酸的不完全剪切,这些高度的异质性会造成分离上的困难。采用 CIEF-MS 实现了八个电荷变异体的良好分离,不仅和 iCIEF-UV 的结果一致,同时也和文献报道一致。但是由于西妥昔单抗复杂的糖基化修饰,通过质谱获得的分子量信息不足以反应修饰的情况。

图 6. 西妥昔单抗 CIEF-MS 分析结果图

西妥昔单抗亚基水平的分析

针对西妥昔单抗这类具有复杂异质性的抗体,通过 IdeS 酶切和 DTT 还原降低其复杂程度,更利于质谱检测。通过高分辨质谱检测,IdeS 酶切后的八个变异体峰及 IdeS 酶切同时 DTT 还原后得到的 11 个变异体都得以检测。研究发现,西妥昔单抗的电荷异质性主要源于 Fc 区末端赖氨酸的异质性、Fd’ 区 N-羟乙酰神经氨酸和可能存在的脱酰胺修饰。轻链上未发现有电荷异质性。

图 7. 亚基水平 CIEF-MS 分析流程图

安捷伦 CE-QTOF 解决方案不仅兼顾了毛细管电泳的高效分离,离子源接口的高灵敏度和高分离度,也实现了质谱的高灵敏高分辨检测。在完整蛋白分析的层次上增加亚基水平的解决方案,即使是具有高度复杂异质性的抗体分析也能轻松应对。

参考文献:

1. 安捷伦应用文献 5994-0672EN

2. Jun Dai,*,† Jared Lamp,‡ QiangweiXia,‡ and Yingru Zhang†, Capillary Isoelectric Focusing-Mass SpectrometryMethod for the Separation and Online characterization of Intact Monoclonal AntibodyCharge Variants. Anal Chem. 2018 Feb 6;90(3):2246-2254

3. Jun Dai, and Yingru Zhang, AMiddle-Up Approach with Online Capillary Isoelectric Focusing-Mass Spectrometryfor In-depth Characterization of Cetuximab Charge Heterogeneity. Anal. Chem.,2018, 90 (24), pp 14527–14534

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