2021年1-9月，吉凯基因的客户们硕果累累，已取得科研成果近3000篇，其中10分以上文章超100篇。
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肿 瘤
#1
p113 isoform encoded by CUX1 circular RNA drives tumor progression via facilitating ZRF1/BRD4 transactivation.
发表期刊：Molecular Cancer. IF= 27.401
发表单位：华中科技大学同济医学院附属协和医院
吉凯助力：ZRF1 cDNA，ecircCUX1 shRNAs(GV298载体)
在血清剥夺处理的神经母细胞瘤细胞中，研究人员发现了一种新的 113 个氨基酸的同源框CUT 样 1 (CUX1) 蛋白亚型 (p113)。进一步验证表明，核 p113 由 circ-CUX1编码，可促进神经母细胞瘤细胞的脂质代谢重编程、线粒体活性、增殖、侵袭和转移。在机制上，p113 与ZRF1、BRD4 相互作用形成转录调控复合物，并介导 ZRF1/BRD4 的反式激活，上调 ALDH3A1、NDUFA1 和 NDUFAF5（这些是脂肪醛转化为脂肪酸、脂肪酸 β-氧化和线粒体复合物 I 活性必需的）。利用阻断 p113-ZRF1 相互作用的抑制肽可抑制神经母细胞瘤细胞的肿瘤发生和侵袭性。在临床神经母细胞瘤病例中，p113、ZRF1 或 BRD4 的高表达与患者的不良生存率相关。总之，由 CUX1 编码的 p113 亚型通过促进 ZRF1/BRD4 反式激活来驱动肿瘤进展。
#2
RNA m6A demethylase FTO-mediated epigenetic up-regulation of LINC00022 promotes tumorigenesis in esophageal squamous cell carcinoma.
发表期刊：JOURNAL OF EXPERIMENTAL & CLINICAL CANCER RESEARCH. IF= 11.161
发表单位：郑州大学附属郑州中心医院/郑州大学
吉凯助力：YTHDF2过表达质粒、LINC00022 和 FTO 干扰/过表达慢病毒、HiTransG A/HiTransG P 病毒感染增强液
该研究通过生物信息学方法鉴别出一个新的食管癌相关的LncRNA LINC00022，并探索了其在食管鳞状细胞癌ESCC发生中的作用和机制。发现LINC00022在ESCC 中呈现高表达状态，FTO介导的LINC00022 m6A 去甲基化促进了ESCC 体内肿瘤的生长。机制上讲，LINC00022通过调节抑癌蛋白p21的不稳定性影响了细胞周期进展而驱动食管癌的发生。该研究为揭示m6A修饰调控LncRNA在食管癌发生中的作用提供新的见解，并且为食管癌的防治提供新的分子靶点。
#3
Radiation induces NORAD expression to promote ESCC radiotherapy resistance via EEPD1/ATR/Chk1 signalling and by inhibiting pri-miR-199a1 processing and the exosomal transfer of miR-199a-5p.
发表期刊：JOURNAL OF EXPERIMENTAL & CLINICAL CANCER RESEARCH. IF= 11.161
发表单位：西安交通大学第一附属医院
吉凯助力：NORAD和EEPD1干扰慢病毒、PUM1过表达质粒、HR reporter、I-SceI 表达质粒
该研究展示了DNA损伤激活了lncRNA-NORAD，这对食管鳞状细胞癌ESCC放射抗性至关重要。NORAD在抗辐射ESCC细胞中高水平表达。放射治疗通过增强其序列中的H3K4me2富集来促进NORAD表达。体内外条件下，NORAD敲低的细胞对辐射有显着超敏反应。NORAD需要在放射治疗时启动停止叉的修复和重新启动、G2周期停止和同源重组修复。机制上，NORAD通过竞争性结合来自pri-miR-199a1的PUM1，抑制pri-miR-199a1的加工从而抑制miR-199a-5p表达。NORAD敲低细胞中成熟的miR-199a-5p被包装成外泌体；miR-199a-5p通过靶向EEPD1然后抑制ATR/Chk1信号通路来恢复放射抗性细胞的放射敏感性。同时，NORAD敲低可抑制PD-L1的泛素化，从而在小鼠模型中对辐射和抗PD-1治疗产生更好的反应。总之，辐射诱导lncRNA NORAD表达通过EEPD1/ATR/Chk1信号传导和抑制pri-miR-199a1加工和miR-199a-5p的外泌体转移来促进ESCC放疗抗性，lncRNA NORAD可作为ESCC的潜在的治疗靶点。
#4
ALKBH5-HOXA10 loop-mediated JAK2 m6A demethylation and cisplatin resistance in epithelial ovarian cancer.
发表期刊：JOURNAL OF EXPERIMENTAL & CLINICAL CANCER RESEARCH. IF= 11.161
发表单位：南京医科大学第一附属医院
吉凯助力：ALKBH5和HOXA10 过表达慢病毒、JAK2 3′UTR luciferase 报告质粒
ALKBH5在顺铂耐药的上皮性卵巢癌EOC中上调，并在体内外促进癌细胞顺铂耐药。值得注意的是，HOXA10 与 ALKBH5 形成一个环，并被发现是 ALKBH5 的上游转录因子。HOXA10 过表达也促进了 EOC 细胞在体内和体外的化学抗性。MeRIP-seq 和 RNA-seq 的综合结果表明 JAK2 是 ALKBH5 靶向的 m6A 修饰基因。JAK2/STAT3 信号通路被 ALKBH5-HOXA10 环的过度表达激活，导致 EOC 化学抗性。ALKBH5 和 HOXA10 敲低或抑制过度表达 ALKBH5-HOXA10 的 EOC 细胞中的 JAK2/STAT3 信号通路，可以挽救细胞对顺铂的敏感性。总之，ALKBH5-HOXA10环通过介导JAK2 m6A去甲基化共同激活JAK2/STAT3信号通路，促进EOC对顺铂的耐药性，因此，抑制 ALKBH5-HOXA10 环表达可能是克服 EOC 中顺铂耐药性的潜在策略。
#5
TAGLN mediated stiffness-regulated ovarian cancer progression via RhoA/ROCK pathway.
发表期刊：JOURNAL OF EXPERIMENTAL & CLINICAL CANCER RESEARCH. IF= 11.161
发表单位：华中科技大学
吉凯助力：Luciferase 慢病毒
研究人员发现大网膜转移瘤与成对的卵巢癌 (OC) 原发性肿瘤相比，结缔组织形成中的网膜转移更硬，更丰富，并进一步证明基质僵硬可以显着调节 OC 进展。值得注意的是，编码肌动蛋白交联/胶凝蛋白的 TAGLN 被鉴定为一种有效的机械敏感基因，它可以与 Src 激活形成一个调节环，从而通过调控RhoA/ROCK信号通路介导僵硬调控OC进程。总之，TAGLN可作为卵巢癌的潜在治疗靶点，靶向TAGLN可能为卵巢癌治疗提供良好的临床治疗价值
#6
LncRNA ZNFTR functions as an inhibitor in pancreatic cancer by modulating ATF3/ZNF24/VEGFA pathway.
发表期刊：Cell Death & Disease. IF= 8.469
发表单位：华中科技大学同济医学院附属协和医院
吉凯助力：ZNFTR, ZNF24, ATF3过表达质粒
使用lncRNA芯片分析技术，发现lncRNA BM466146.1 在胰腺癌PC 组织中下调，并通过调节ZNF24的表达发挥抑制作用。机制上，ZNFTR 与激活转录因子 3 (ATF3) 相互作用并将 ATF3 与 ZNF24 启动子隔离，从而增加 ZNF24 表达。此外，ZNF24 通过抑制血管内皮生长因子 A (VEGFA) 的转录来抑制 PC 细胞的增殖、转移和促血管生成能力。因此，PC中ZNFTR的下调导致ZNF24的表达降低，进而导致VEGFA的上调，最终促进PC进展。同时，ZNFTR 被 HIF-1α/HDAC1 复合物介导的去乙酰化转录抑制。临床结果进一步表明，ZNFTR 的低表达与较差总生存时间有关。总之，ZNFTR 是一种缺氧反应性 lncRNA，通过调节 PC 中的 ATF3/ZNF24/VEGFA 通路发挥抑制作用。
#7
KLK8 promotes the proliferation and metastasis of colorectal cancer via the activation of EMT associated with PAR1.
发表期刊：Cell Death & Disease. IF= 8.469
发表单位：复旦大学/海军军医大学
吉凯助力：KLK8过表达质粒，KLK8 siRNAs
研究发现 KLK8 对 RKO 和 SW480 细胞的增殖、迁移和侵袭具有促进作用。上皮间质转化 (EMT) 在 KLK8 对 结直肠癌CRC 的促进作用中发挥了重要作用。此外，蛋白酶激活受体-1 (PAR-1) 拮抗剂 SCH79797 减弱了 KLK8 上调RKO 和 SW480 细胞中的增殖、迁移和侵袭，并减少了异种移植模型的肿瘤体积和肝转移模型的转移结节。SCH79797 在体内外均可逆转 KLK8 对EMT过程的积极作用。综上所述，这些发现首次证明 了KLK8 促进 EMT 和 CRC 进展，且这种作用可能由 PAR1 介导。
#8
EMP3 negatively modulates breast cancer cell DNA replication, DNA damage repair, and stem-like properties.
发表期刊：Cell Death & Disease. IF= 8.469
发表单位：中国医科大学
吉凯助力：EMP3干扰慢病毒GV112，EMP3和YTHDC1 过表达质粒(GV219载体)
研究人员通过体外培养MDA-MB-231、HS578T、MCF7、SK-BR-3和BT474等乳腺癌细胞，首次发现EMP3可抑制S期的细胞周期起始、DNA复制、DNA损伤修复、化疗耐药性、干细胞样特性以及Akt-mTOR信号通路的激活。此外，EMP3 负向调节 BRCA1 和 RAD51 表达，表明 EMP3 抑制 DNA 双链断裂的同源重组修复。因此，EMP3 使乳腺癌细胞对 DNA 损伤药物阿霉素敏感。EMP3 下调 YTHDC1，这至少部分介导了 EMP3 对乳腺癌细胞的影响。总之，EMP3 下调可能是导致乳腺癌化疗耐药的原因。
心血管
Aorta smooth muscle-on-a-chip reveals impaired mitochondrial dynamics as a therapeutic target for aortic aneurysm in bicuspid aortic valve disease.
发表期刊：Elife. IF= 8.14
发表单位：复旦大学附属中山医院/复旦大学生物医学研究院
吉凯助力：NOTCH1干扰慢病毒
研究人员使用人主动脉组织的蛋白质分析显示二叶式主动脉瓣-胸主动脉瘤（BAV-TAA） 中 NOTCH1 表达不足和线粒体动力学受损。NOTCH1 敲低的人主动脉平滑肌细胞 HAoSMCs 表现出减少的收缩表型，并伴有减弱的线粒体融合。此外，线粒体融合激活剂（来氟米特和特立氟胺）或线粒体裂变抑制剂（Mdivi-1）处理部分挽救了 BAV-TAA 患者来源的 HAoSMC 线粒体动力学紊乱。总之，主动脉平滑肌芯片模型模拟了人体主动脉生物力学病理生理参数，为主动脉疾病分子机制研究及相关药物筛选提供了平台，这种主动脉平滑肌芯片模型和人体组织蛋白质组学分析表明，线粒体动力学受损可能是 BAV-TAA 的潜在治疗靶点。
神 经
The E3 ubiquitin ligase TRIM31 is involved in cerebral ischemic injury by promoting degradation of TIGAR.
发表期刊：Redox Biology. IF= 11.799
发表单位：山东大学
吉凯助力：TIGAR干扰AAV9，Myc-TIGAR质粒。AAV9-shTIGAR用于小鼠左侧皮质注射，病毒滴度1.2 × 1012 μg/mL，注射体积4 μL，注射速率0.2 μL/min
该研究发现TRIM31是TIGAR的新型E3泛素连接酶，可通过其B-BOX区与TIGAR结合并促进TIGAR的泛素化蛋白酶体降解。在脑缺血病理进程中，TRIM31可以负性调控TIGAR的蛋白水平，抑制磷酸戊糖通量，减慢了脑内清除过量ROS的进程，加剧了线粒体的功能障碍，从而导致缺血脑损伤。总之，TRIM31通过调节TIGAR 蛋白水平在缺血性脑损伤中发挥关键作用，可能是缺血性中风的潜在治疗靶点。
1.实验技术干货
2.蛋白质组学研究
3.腺病毒简介及应用
4.临床基础研究思路解析
5.组织特异性腺相关病毒
6.单细胞测序
7.慢病毒实验操作指南
8.悬浮细胞专用病毒
9.靶点设计/数据库教程
10.测序技术研究与应用
11.非编码RNA研究技术与应用
12.腺相关病毒选择/应用
13.表观遗传研究
14.文章解析
15.国自然课题设计思路解析
16.生物信息分析及工具
17.外泌体研究
18.肿瘤免疫研究
19.高分文章
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