伴随2022下半年10×Genomics Visium Cytassist 仪器的推出，FFPE样本的空间转录组技术服务进入V2.0时代！过往需要组织切片贴合及脱片测试，目前在该仪器上30min可完成组织切片上转录组分析物的转移，并且能获得更加准确的空间信息。
图1 | 桌面型10×Genomics Visium Cytassist 仪器展示
下面的表格让我们进一步了解CytAssist 与过往的区别。
表1 | 10×Genomics Visium CytAssist与Visium 1.0的主要区别
备注：DV200表示大于 200 个核苷酸的 RNA 片段占所有 RNA 片段的百分比
综上我们引进更好的仪器平台，为大家提供更方便快捷的服务流程！
服务流程交给我们，样本如何准备呢，小欧整理如下：
石蜡块
石蜡块不超过5年，过往低温保存可进一步保证RNA的完整性。
石蜡块务必固定在石蜡的包埋盒内，方便后续切片。
多个石蜡块为防止在快递过程中相互磕碰，需要独立包装，可采用气泡膜、锡纸、玻片盒等保护方式，最终放入一大塑料袋中统一寄送。
石蜡块冰袋快递至公司样本管理部，夏季推荐采用干冰寄送，冬季可常温寄送。
石蜡玻片
由于部分石蜡块不方便提供，如无法取出病理实验室，客户可按照以下要求提供石蜡玻片。
图2 | 10×Genomics官方推荐的品牌玻片有效区域示意图
注：A、B、C三种类型在国内均比较少见，D型可订购
石蜡玻片的规格要求
1.1 玻片规格
10×Genomics官方推荐Sigma品牌（即图2中的D 玻片），如没有可暂用国产世泰（规格类似图2中的C 玻片）替代 ，注意该品牌或其他品牌有可能导致与Visium Cytassist设备不匹配后的漏液。
1.2 石蜡切片厚度
5μm，超过该厚度会导致实验处理条件与之不匹配。
1.3 石蜡切片数量
表2 | 10× Visium CytAssist FFPE空间转录组测序石蜡切片提供量
组织贴片的位置
为保证切片选取的组织区域与Visium玻片的捕获区域精确对齐，组织贴片的位置至关重要。
图2绿色框标记的区域为有效区域，长边两边各留15mm，短边两边各留5mm，感兴趣的区域务必放置在有效区域内。
注意有标签的玻片也要符合上述标准。
切片的处理
42℃烘箱烤片处理3小时， 室温过夜干燥（建议采用图3干燥盒/密封袋内放置硅胶干燥剂）。
冰袋快递至公司样本管理部，注意保护防震，勿破损。
图3 | 干燥密封保存示意图（图中为柱状硅胶干燥剂）
过往保存的FFPE珍贵样本将在新技术的加持下发挥更大价值！快快搜索一下样本库看看哪些样本可以进一步挖掘数据，具体问题可咨询您的销售工程师或在微信公众号后台留言。
最后再特别预告另外一项新技术：最新推出的10× Genomics Single Cell Gene Expression Flex 全套解决方案将开启FFPE样本在单细胞转录组测序技术中的应用，该技术与本文空间转录组测序技术的强强联合，必将为大家带来更多研究成果！
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排版人：小久
原创声明：本文由欧易生物(OEBIOTECH)学术团队报道，本文著作权归文章作者所有。欢迎个人转发及分享，未经作者的允许禁止转载。
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