DNA复制机制和共转录R环之间发生冲突时,会导致癌细胞基因组不稳定性,进而影响DNA合成。本文中,我们展示了ATP依赖性染色质重构INO80复合体可以促进R环解析,防止癌细胞中的复制相关的DNA损伤。
我们使用STED超高分辨率显微镜进行测量,INO80和R环之间具有前所未有的精密共定位。
标题图像:INO80(蓝色)和R环(黄色)的3D体表面模型
在我们的实验中,相比共聚焦成像(250 nm),STED能达到大约50 nm的分辨率,这使我们能够有较高的确定性区分真假共定位事件。使用STED可以轻松观察到INO80亚基和R环亚基之间的共定位,而通过共聚焦成像观察到的INO80和R环之间的多个共定位事件,经STED观察是分离的不同亚基。
在所有分析的细胞中,我们发现相比非共定位R环,INO80共定位的R环明显更加紧密、体积和长度也更大。这些数据表明,INO80复合物与细胞核中最大、最浓缩的R环域相关。
图1:STED解析INO80和R环的相对位置。
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Prendergast L., McClurg U.L., Hristova R., Berlinguer-Palmini R., Greener S., Veitch K., Hernandez I., Pasero P., Rico D., Higgins J.M.G., Gospodinov A. & Papamichos-Chronakis M.:
Resolution of R-loops by INO80 promotes DNA replication and maintains cancer cell proliferation and viability
Nature Communications volume 11, Article number: 4534 (2020)
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